288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0378 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  65.94 
 
 		 156 aa  179  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  61.59 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  62.32 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  62.32 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  60.87 
 
 		 155 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  51.06 
 
 		 160 aa  146  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  44.93 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  44.2 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  48.12 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  45.39 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  45.26 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  43.97 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  44.44 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  43.48 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  43.8 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  46.81 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  43.07 
 
 		 160 aa  104  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  38.3 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  42.55 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  43.97 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  42.55 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  42.25 
 
 		 185 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  46.1 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  44.68 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  42.55 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  52.69 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  57.65 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  41.84 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  47.12 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  45.45 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  39.5 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  43.33 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0100  rRNA large subunit methyltransferase  40.14 
 
 		 164 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465557 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  43.33 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  39.57 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  38.66 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  49.41 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  42.24 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  40.29 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  41.01 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  40.29 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  35.92 
 
 		 159 aa  84.3  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  46.67 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  40.44 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  40.29 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  45.63 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1948  rRNA large subunit methyltransferase  41.13 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  34.78 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  39.26 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  41.13 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  38.41 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  37.7 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  41.13 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  32.88 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2624  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0866518  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  44.55 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  37.68 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  37.68 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  33.57 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  36.96 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  41.55 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  33.57 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  42.02 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  35.09 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  35.09 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  38.64 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  41.55 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  41.55 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  41.55 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  41.55 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  37.32 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  39.57 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  37.41 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  40.58 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  40.58 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  41.55 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  45.19 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  32.43 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  41.35 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  39.44 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  33.1 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  38.46 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  34.23 
 
 		 159 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  35.16 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  30 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  30 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  38.03 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  38.54 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  34.71 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  44.23 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2246  rRNA large subunit methyltransferase  48.24 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.37412  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  32.17 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  34.26 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>