78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1665 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 
203 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  47.53 
 
 
301 aa  134  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  40.14 
 
 
192 aa  126  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  30.57 
 
 
183 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  33.54 
 
 
183 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  35.33 
 
 
183 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  28.22 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  35.47 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  30.91 
 
 
271 aa  72  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  30.34 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  29.66 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  29.66 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  33.8 
 
 
388 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  31.41 
 
 
327 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.32 
 
 
350 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  28.42 
 
 
346 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  32.37 
 
 
263 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  34.93 
 
 
276 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0407  nuclease (SNase-like)  33.54 
 
 
308 aa  61.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  33.12 
 
 
324 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  34.13 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  29.76 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  29.76 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  30.34 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  26.4 
 
 
178 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  37.89 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  34.17 
 
 
323 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  29.73 
 
 
372 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.27 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  30.72 
 
 
374 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  29.38 
 
 
237 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  27.4 
 
 
209 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  37.96 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  24.32 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  24.32 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  34.03 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  39.13 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  39.13 
 
 
226 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  27.27 
 
 
256 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  32.41 
 
 
284 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  30 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  30 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  24.83 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  27.78 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  30.5 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  27.86 
 
 
153 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  28.57 
 
 
148 aa  48.9  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  27.1 
 
 
351 aa  48.9  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  28.19 
 
 
227 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  34.78 
 
 
161 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  33.56 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  31.1 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  26.53 
 
 
333 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  29.93 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  31.15 
 
 
180 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.37 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  25.68 
 
 
249 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.37 
 
 
171 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  31.82 
 
 
382 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  28.36 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.01 
 
 
187 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  30.38 
 
 
311 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  38.46 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  30.43 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  26.9 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  32.47 
 
 
273 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  28.66 
 
 
247 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  29.53 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  29.45 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  25.24 
 
 
383 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  28.19 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  29.19 
 
 
286 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  25.5 
 
 
197 aa  42.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  27.71 
 
 
266 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  29.08 
 
 
224 aa  41.6  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  27.52 
 
 
221 aa  41.2  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>