283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5118 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  56.71 
 
 		 658 aa  721    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 666 aa  1340    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  59.28 
 
 		 630 aa  760    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  82.43 
 
 		 649 aa  1056    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  36.17 
 
 		 548 aa  283  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  35.14 
 
 		 558 aa  281  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  34.84 
 
 		 557 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  35.51 
 
 		 546 aa  279  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  35.62 
 
 		 561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  35.05 
 
 		 548 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  35.25 
 
 		 554 aa  273  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  34.9 
 
 		 558 aa  271  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.94 
 
 		 550 aa  270  8e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  34.49 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  35.95 
 
 		 548 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  35.94 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  35.54 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.34 
 
 		 558 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  39.43 
 
 		 542 aa  267  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  36.25 
 
 		 555 aa  267  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  35.54 
 
 		 549 aa  266  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  34.54 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  35.5 
 
 		 545 aa  265  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  34.56 
 
 		 548 aa  264  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  33.79 
 
 		 551 aa  264  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  38.23 
 
 		 549 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  38.23 
 
 		 549 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  38.23 
 
 		 549 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.29 
 
 		 548 aa  263  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  35.2 
 
 		 548 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  34.54 
 
 		 559 aa  263  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  35.36 
 
 		 545 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.44 
 
 		 555 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  37.7 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  34.81 
 
 		 550 aa  259  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  37.41 
 
 		 590 aa  254  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 		 602 aa  253  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  34.76 
 
 		 548 aa  253  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  34.17 
 
 		 551 aa  251  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  29.98 
 
 		 564 aa  249  9e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  31.22 
 
 		 551 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  26.95 
 
 		 838 aa  171  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  32.47 
 
 		 451 aa  169  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  29.2 
 
 		 818 aa  163  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  33.16 
 
 		 440 aa  160  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  29.48 
 
 		 444 aa  158  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  29.01 
 
 		 720 aa  157  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  28.09 
 
 		 781 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  29.02 
 
 		 531 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  35 
 
 		 647 aa  151  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  27.81 
 
 		 866 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  33.99 
 
 		 652 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  26.89 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  30.26 
 
 		 462 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  34.66 
 
 		 650 aa  144  6e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  29.29 
 
 		 443 aa  144  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  30.25 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  32.01 
 
 		 654 aa  139  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  29.65 
 
 		 468 aa  138  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  30 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  30.39 
 
 		 494 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  31.58 
 
 		 444 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  27.01 
 
 		 590 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  28.74 
 
 		 451 aa  136  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  29.53 
 
 		 466 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  29.71 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  29.9 
 
 		 451 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  29.02 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  27.55 
 
 		 517 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  30.02 
 
 		 470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  31.55 
 
 		 449 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  30.62 
 
 		 479 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  30.17 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  27.73 
 
 		 509 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  27.73 
 
 		 509 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  30.46 
 
 		 531 aa  123  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  27.87 
 
 		 630 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 463 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 479 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 479 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 479 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  28.73 
 
 		 485 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  28.45 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  29.03 
 
 		 925 aa  85.5  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  34.13 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  24.23 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  32.22 
 
 		 796 aa  81.6  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  23.97 
 
 		 489 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  26.25 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  26.25 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  30.77 
 
 		 794 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  27.04 
 
 		 768 aa  78.2  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  24.07 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  25.47 
 
 		 998 aa  76.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.17 
 
 		 633 aa  75.1  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  34.07 
 
 		 795 aa  75.1  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>