230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3460 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  85.79 
 
 		 361 aa  636    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 362 aa  729    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  68.61 
 
 		 361 aa  500  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  69.53 
 
 		 369 aa  483  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  66.67 
 
 		 360 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  32.34 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 375 aa  133  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  30.84 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  29.82 
 
 		 384 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  32.03 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  31.09 
 
 		 388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  29.29 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 391 aa  106  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  30.72 
 
 		 408 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 		 386 aa  99.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 385 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 395 aa  96.3  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  30.23 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 393 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.8 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.54 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  31.17 
 
 		 365 aa  86.7  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.18 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.88 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.96 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  23.65 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  23.61 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  23.96 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.67 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.05 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.9 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.95 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  29.03 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  25.3 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.8 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  24.64 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  30.91 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.14 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  21.68 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  26.17 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  29.32 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.23 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  26.92 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  26.85 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  32.67 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.38 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  27.7 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  21.82 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  32.2 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  26.8 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  24.5 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  23.49 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  27.32 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  26.95 
 
 		 503 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.08 
 
 		 507 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  20.65 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  32.89 
 
 		 492 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>