79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6215 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 493 aa  960    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  28.78 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.4 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  24 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  27.94 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  20.65 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.35 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  19.14 
 
 		 471 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.18 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  19.78 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 463 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  18.04 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 442 aa  53.9  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 627 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 517 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 453 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.72 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 731 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  18.51 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  21.79 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.29 
 
 		 487 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 495 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  24.06 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  20.32 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1470 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  23.47 
 
 		 499 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 449 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 435 aa  47  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 473 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 473 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 1496 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  20.06 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  21.41 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  22.25 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6346  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.36 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  27.36 
 
 		 576 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 635 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.09 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  19.83 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.27 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  26.64 
 
 		 499 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 443 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.2 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  25.99 
 
 		 498 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  24.75 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  28.65 
 
 		 455 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 435 aa  43.9  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 436 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 441 aa  43.5  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>