More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1272 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  67.51 
 
 
1547 aa  1329    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  62.37 
 
 
1609 aa  1186    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  69.31 
 
 
1598 aa  1382    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  48.25 
 
 
1078 aa  694    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  47.51 
 
 
969 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  46.68 
 
 
897 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.8 
 
 
1684 aa  832    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  52.91 
 
 
1617 aa  942    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  66.39 
 
 
1398 aa  1325    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  100 
 
 
1190 aa  2352    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  63.42 
 
 
1583 aa  1238    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  54.85 
 
 
1013 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  47.26 
 
 
972 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  52.53 
 
 
1599 aa  1014    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  46.56 
 
 
965 aa  638    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  67.46 
 
 
1607 aa  1246    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  49.46 
 
 
973 aa  690    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  51.93 
 
 
1046 aa  818    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  56.99 
 
 
1267 aa  643    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.51 
 
 
1623 aa  824    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  68.17 
 
 
1626 aa  1319    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  55.89 
 
 
1032 aa  804    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
969 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 
947 aa  631  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  45.06 
 
 
1005 aa  588  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  45.7 
 
 
1085 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  44.73 
 
 
1014 aa  588  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  44.92 
 
 
1020 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  45.79 
 
 
698 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  68.61 
 
 
425 aa  361  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.42 
 
 
1240 aa  322  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.01 
 
 
1823 aa  321  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  33.78 
 
 
1314 aa  303  9e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  34.2 
 
 
1353 aa  303  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.19 
 
 
1686 aa  299  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1434  WD40 repeat, subgroup  57.74 
 
 
304 aa  289  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.34 
 
 
1711 aa  277  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  34.78 
 
 
1344 aa  270  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.01 
 
 
1236 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.42 
 
 
1553 aa  262  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.08 
 
 
1760 aa  252  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  35.85 
 
 
1157 aa  232  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 
1481 aa  227  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  30.38 
 
 
1308 aa  225  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 
1334 aa  221  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.9 
 
 
1357 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  35.75 
 
 
1152 aa  211  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  31.02 
 
 
1699 aa  196  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  30 
 
 
1733 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  27.87 
 
 
1265 aa  181  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  36 
 
 
1152 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.05 
 
 
676 aa  176  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  26.69 
 
 
902 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.26 
 
 
647 aa  174  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.88 
 
 
664 aa  174  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
700 aa  173  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  29.21 
 
 
1230 aa  173  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  28.11 
 
 
1657 aa  172  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  35.81 
 
 
618 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  38.49 
 
 
597 aa  171  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
615 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.45 
 
 
681 aa  167  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  29.15 
 
 
1073 aa  167  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.54 
 
 
603 aa  167  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  37.33 
 
 
672 aa  167  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4621  adenylate/guanylate cyclase  37.58 
 
 
687 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.828122 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 
651 aa  165  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.7 
 
 
668 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  34.21 
 
 
626 aa  164  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.77 
 
 
607 aa  164  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
691 aa  164  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 
642 aa  164  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.66 
 
 
681 aa  164  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  37.87 
 
 
661 aa  163  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1271  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  83.51 
 
 
291 aa  163  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000038276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 
894 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  38.77 
 
 
646 aa  163  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  35.54 
 
 
668 aa  163  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.77 
 
 
1491 aa  162  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  28.51 
 
 
1026 aa  162  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.86 
 
 
579 aa  161  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.84 
 
 
613 aa  162  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  33.65 
 
 
625 aa  162  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  36.89 
 
 
609 aa  161  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.04 
 
 
635 aa  161  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  35.81 
 
 
842 aa  161  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.36 
 
 
1557 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  31.32 
 
 
885 aa  160  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  38.37 
 
 
667 aa  159  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  37.24 
 
 
625 aa  159  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 
862 aa  159  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  34.54 
 
 
624 aa  159  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  34.54 
 
 
624 aa  159  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  34.54 
 
 
624 aa  159  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.49 
 
 
700 aa  158  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.84 
 
 
693 aa  158  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  35.13 
 
 
951 aa  158  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 
690 aa  157  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
938 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
636 aa  157  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>