83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2697 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  100 
 
 		 431 aa  853    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  52.94 
 
 		 388 aa  319  5e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  45.66 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  48.4 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  43.89 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  37.02 
 
 		 383 aa  220  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  29.55 
 
 		 342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.77 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  29.39 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.88 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  28.4 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  28.48 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  28.48 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  28.48 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  28.48 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  28.48 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  28.48 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  28.48 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  27.88 
 
 		 327 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.05 
 
 		 367 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  28.48 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  28.48 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  28.48 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  28.48 
 
 		 327 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  30.28 
 
 		 332 aa  116  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  28.27 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  28.79 
 
 		 327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  27.52 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  27.08 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  28.4 
 
 		 338 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.09 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.1 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.3 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  26.81 
 
 		 330 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.73 
 
 		 334 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  26.84 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  27.71 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  27.27 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  26.55 
 
 		 358 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  27.74 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.08 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  27.83 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.71 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  27.55 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  26.36 
 
 		 328 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  27.16 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.54 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  28.83 
 
 		 327 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  25.69 
 
 		 330 aa  96.3  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.09 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  25.3 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  28.53 
 
 		 342 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  29.08 
 
 		 327 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.13 
 
 		 337 aa  93.6  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.64 
 
 		 325 aa  92.8  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  28.3 
 
 		 335 aa  93.2  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  24.01 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.52 
 
 		 359 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.49 
 
 		 325 aa  90.1  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.08 
 
 		 357 aa  90.5  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.3 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.62 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  28.95 
 
 		 326 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.44 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.07 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  24.52 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.22 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.19 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.37 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.39 
 
 		 338 aa  53.5  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.3 
 
 		 337 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0538  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  28.4 
 
 		 345 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0468  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  21.97 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 347 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0470  2-aminoethylphosphonate ABC transporter 2-aminoethylphosphonate binding protein  22.65 
 
 		 337 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0531  2-aminoethylphosphonate ABC transporter 2-aminoethylphosphonate binding protein  21.97 
 
 		 337 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0476  2-aminoethylphosphonate ABC transporter 2-aminoethylphosphonate binding protein  21.97 
 
 		 337 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.547307 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.71 
 
 		 334 aa  43.1  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>