More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2270 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2270  PfkB domain protein  100 
 
 
387 aa  753    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  50.65 
 
 
289 aa  256  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  47.85 
 
 
295 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2964  PfkB domain protein  44 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.330402  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  36.08 
 
 
308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  35.82 
 
 
310 aa  123  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
305 aa  123  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 
304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  34.19 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  36.07 
 
 
321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  31.92 
 
 
302 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 
302 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  25.72 
 
 
302 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 
298 aa  99.8  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 
305 aa  97.1  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.08 
 
 
302 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.1 
 
 
323 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29.36 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  35.09 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  24.36 
 
 
302 aa  89.7  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  33.61 
 
 
297 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  29.17 
 
 
291 aa  87  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  34.78 
 
 
288 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  35.39 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  32.85 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  31.82 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  31.82 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  32.84 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  31.03 
 
 
309 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  32.46 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  32.51 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  32.22 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  34.94 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  31.46 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  30.26 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.4 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  28.2 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  32.77 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  29.55 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  32.41 
 
 
316 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  25.39 
 
 
290 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.24 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  33.7 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.33 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.33 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.33 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2117  PfkB domain protein  28.53 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496872  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30.77 
 
 
317 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  31.69 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  35.74 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  32.3 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.69 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  33.6 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  35.56 
 
 
287 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.74 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  31.71 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.34 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  26.89 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  31.63 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.51 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  28.57 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  31.01 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  31.7 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  28.63 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  28.26 
 
 
645 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.1 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  28.26 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  30.77 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  26.22 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  28.26 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  28.68 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.9 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  32.32 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  30.25 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  26.61 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  26.72 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  28.34 
 
 
305 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.89 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  31.73 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  32.09 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  30.45 
 
 
311 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  31.46 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  31.2 
 
 
308 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.4 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  34.13 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  32.35 
 
 
326 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  30.42 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  28.68 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  32.62 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0480  PfkB domain protein  25.83 
 
 
275 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.73 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  31.49 
 
 
307 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  30.58 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  30.58 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  27.41 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  27.78 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  30.42 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>