102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0529 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1251    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  40.65 
 
 
662 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  40.64 
 
 
651 aa  273  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  38.92 
 
 
671 aa  249  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  35.54 
 
 
673 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  26.78 
 
 
361 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  27.78 
 
 
702 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  33.06 
 
 
997 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  44.19 
 
 
587 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  29.92 
 
 
667 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  27.4 
 
 
640 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  37.5 
 
 
674 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  32.97 
 
 
738 aa  61.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  38 
 
 
684 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  27.27 
 
 
673 aa  60.8  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  38.6 
 
 
860 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  22.03 
 
 
594 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  33.59 
 
 
240 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  40.19 
 
 
698 aa  57.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  34.51 
 
 
679 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  25 
 
 
635 aa  58.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  35.24 
 
 
971 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  29.14 
 
 
682 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  30.41 
 
 
773 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  30.53 
 
 
637 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  21.91 
 
 
634 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  30.53 
 
 
635 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  24.13 
 
 
682 aa  54.7  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  27.91 
 
 
634 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  35.58 
 
 
994 aa  54.7  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  30.33 
 
 
989 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  28.25 
 
 
946 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  26.74 
 
 
634 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  32.26 
 
 
634 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  29.25 
 
 
642 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  28.7 
 
 
364 aa  52  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0286  hypothetical protein  29.17 
 
 
681 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  22.82 
 
 
633 aa  50.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  28.24 
 
 
634 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  34.43 
 
 
566 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 
639 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  29.01 
 
 
634 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  25.96 
 
 
987 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0109  hypothetical protein  28.8 
 
 
672 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  27.75 
 
 
624 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  29.01 
 
 
634 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  35.8 
 
 
720 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  29.01 
 
 
634 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  24.58 
 
 
723 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  21.68 
 
 
598 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  33.67 
 
 
644 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  23.1 
 
 
582 aa  48.5  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  23.05 
 
 
559 aa  48.5  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  29.01 
 
 
650 aa  47.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  29.92 
 
 
585 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0466  heat shock protein 90  29.01 
 
 
650 aa  47.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  33.68 
 
 
796 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  30.58 
 
 
631 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  30.53 
 
 
647 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  33.01 
 
 
692 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  22.6 
 
 
617 aa  47.4  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0864  DNA mismatch repair protein  31.4 
 
 
576 aa  47  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  23.84 
 
 
608 aa  46.6  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0484  heat shock protein 90  26.74 
 
 
662 aa  47  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  34.34 
 
 
601 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  31.58 
 
 
665 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4976  heat shock protein 90  24.5 
 
 
678 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  24.38 
 
 
685 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1264  heat shock protein 90  28.67 
 
 
630 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1997  heat shock protein 90  29.46 
 
 
619 aa  45.8  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  28.57 
 
 
628 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  33.91 
 
 
629 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  29.05 
 
 
635 aa  45.4  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  32.67 
 
 
644 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  23.21 
 
 
669 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0296  heat shock protein 90  30.08 
 
 
636 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
626 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  31.71 
 
 
636 aa  45.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
626 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  32.65 
 
 
618 aa  44.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  29.46 
 
 
774 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  30 
 
 
630 aa  44.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  24.42 
 
 
644 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  27.22 
 
 
623 aa  44.3  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  34.34 
 
 
608 aa  44.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  26.15 
 
 
634 aa  44.3  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  27.27 
 
 
647 aa  44.3  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  28.24 
 
 
630 aa  44.3  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  28 
 
 
629 aa  43.9  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
649 aa  43.9  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  23.18 
 
 
639 aa  43.9  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  29.07 
 
 
584 aa  43.9  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  21.9 
 
 
641 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>