68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0499 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  100 
 
 
1379 aa  2739    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  80.18 
 
 
1281 aa  1540    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  33.82 
 
 
1453 aa  545  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  34.35 
 
 
1454 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  32.56 
 
 
2026 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  32.32 
 
 
1276 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  34.41 
 
 
1127 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  32.31 
 
 
979 aa  313  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  33.6 
 
 
869 aa  297  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  38.37 
 
 
2499 aa  283  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  29.79 
 
 
1457 aa  281  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  29.28 
 
 
1438 aa  280  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  31.6 
 
 
1848 aa  277  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  32.29 
 
 
1916 aa  270  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  30.08 
 
 
1143 aa  268  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  27.31 
 
 
2222 aa  257  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  29.45 
 
 
1143 aa  254  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  31.65 
 
 
672 aa  221  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  33.9 
 
 
688 aa  218  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  34.5 
 
 
901 aa  214  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  30.55 
 
 
902 aa  207  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  30.77 
 
 
1596 aa  202  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0521  cytochrome C family protein  41.53 
 
 
383 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  30.61 
 
 
1672 aa  194  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  30.67 
 
 
955 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  32.77 
 
 
1691 aa  188  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  29.58 
 
 
958 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  29.07 
 
 
958 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  32.86 
 
 
1196 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  29.92 
 
 
1521 aa  174  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  29.36 
 
 
957 aa  171  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  28.46 
 
 
1611 aa  148  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  25.58 
 
 
2081 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  26.45 
 
 
2803 aa  99.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  24.13 
 
 
1330 aa  97.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  25.25 
 
 
2912 aa  93.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  23.78 
 
 
1329 aa  92.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  28.19 
 
 
1017 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  33.59 
 
 
939 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  27.3 
 
 
1525 aa  80.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  23.16 
 
 
1329 aa  79.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  26.84 
 
 
1036 aa  79  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  28.24 
 
 
1038 aa  78.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  24.47 
 
 
1053 aa  78.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  26.17 
 
 
1018 aa  76.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  30.7 
 
 
1496 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  27.15 
 
 
563 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  23.68 
 
 
1645 aa  72  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  23.83 
 
 
1017 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  27.33 
 
 
655 aa  70.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  27.09 
 
 
655 aa  68.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  27.45 
 
 
1009 aa  68.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  25.13 
 
 
1046 aa  67  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  30.48 
 
 
455 aa  66.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  26.97 
 
 
655 aa  65.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  29.52 
 
 
455 aa  63.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  28.24 
 
 
656 aa  59.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  27.25 
 
 
457 aa  56.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  24.51 
 
 
431 aa  55.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  25.51 
 
 
454 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  23.5 
 
 
501 aa  53.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  27.53 
 
 
655 aa  48.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  25.24 
 
 
806 aa  47.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  27.84 
 
 
822 aa  47.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0954  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome, NapC/NirT  23.9 
 
 
212 aa  47  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.448088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  24.14 
 
 
487 aa  46.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  31.82 
 
 
336 aa  45.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  22.4 
 
 
461 aa  45.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>