More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0184 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.38 
 
 
714 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.09 
 
 
733 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.45 
 
 
762 aa  788    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.2 
 
 
749 aa  675    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.93 
 
 
788 aa  643    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  64.62 
 
 
734 aa  844    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  63.36 
 
 
745 aa  847    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  63.99 
 
 
713 aa  848    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.95 
 
 
708 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.17 
 
 
691 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.44 
 
 
718 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  53.02 
 
 
691 aa  644    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.36 
 
 
754 aa  680    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.4 
 
 
712 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  56.6 
 
 
706 aa  707    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.79 
 
 
979 aa  680    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.86 
 
 
712 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.7 
 
 
756 aa  668    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
741 aa  1435    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.68 
 
 
704 aa  675    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.8 
 
 
724 aa  705    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.44 
 
 
691 aa  674    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  58.27 
 
 
691 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.44 
 
 
691 aa  674    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.14 
 
 
689 aa  715    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.77 
 
 
723 aa  746    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  56.25 
 
 
766 aa  676    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  62.64 
 
 
729 aa  829    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.24 
 
 
706 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.07 
 
 
708 aa  528  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.65 
 
 
679 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.62 
 
 
697 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.34 
 
 
698 aa  508  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 
693 aa  504  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.09 
 
 
756 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.94 
 
 
706 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.71 
 
 
698 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.46 
 
 
697 aa  475  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.05 
 
 
698 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.95 
 
 
693 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.24 
 
 
695 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.67 
 
 
699 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.73 
 
 
698 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.92 
 
 
691 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.08 
 
 
691 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.47 
 
 
448 aa  256  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.06 
 
 
543 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.84 
 
 
543 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.84 
 
 
543 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.82 
 
 
602 aa  219  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.9 
 
 
1376 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.4 
 
 
545 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.46 
 
 
588 aa  208  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  35.91 
 
 
597 aa  203  8e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.99 
 
 
590 aa  203  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.2 
 
 
626 aa  201  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.75 
 
 
568 aa  200  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.4 
 
 
590 aa  200  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.07 
 
 
646 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 
625 aa  196  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.52 
 
 
592 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.67 
 
 
708 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  39.44 
 
 
637 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  34 
 
 
669 aa  194  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.35 
 
 
552 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.82 
 
 
705 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.56 
 
 
599 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.15 
 
 
637 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.82 
 
 
599 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.88 
 
 
601 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.04 
 
 
563 aa  192  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.1 
 
 
705 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.1 
 
 
705 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  34.1 
 
 
705 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.1 
 
 
705 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.27 
 
 
630 aa  191  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.24 
 
 
705 aa  191  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.87 
 
 
636 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.24 
 
 
705 aa  191  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  33.82 
 
 
705 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.97 
 
 
659 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.42 
 
 
624 aa  190  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 
630 aa  190  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.75 
 
 
592 aa  190  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.53 
 
 
705 aa  190  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.85 
 
 
662 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 
622 aa  190  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.47 
 
 
556 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.83 
 
 
451 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.57 
 
 
618 aa  189  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.62 
 
 
593 aa  188  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.62 
 
 
593 aa  188  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.89 
 
 
607 aa  188  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.53 
 
 
705 aa  188  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 
634 aa  187  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.86 
 
 
607 aa  187  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 
681 aa  187  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.98 
 
 
728 aa  187  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.52 
 
 
681 aa  187  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.75 
 
 
619 aa  187  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>