141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3314 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  49.85 
 
 		 330 aa  288  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  37.42 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  38.36 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  38.44 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  38.11 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  38.11 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  38.11 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  38.11 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  38.11 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  33.77 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  31.23 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  32.69 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  30.91 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  28.99 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  29.5 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  30.1 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  30.08 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  32.59 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  29.7 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  30.6 
 
 		 362 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  30.35 
 
 		 356 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  30.6 
 
 		 362 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  34.6 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  32.96 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  30.28 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  31.23 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  29.97 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  27.38 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  27.44 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  27.1 
 
 		 360 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  29.43 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  30.15 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  30.15 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  28.23 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  30.15 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  30.15 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  30.15 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  28.23 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  30.15 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  29.43 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  30.15 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  30.21 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  29.07 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.9 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  29.85 
 
 		 366 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  31.46 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  31.35 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.64 
 
 		 332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  29.82 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  34.6 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  29.68 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  28.23 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  34.98 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  29.43 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  30.1 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  27.93 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  33.94 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  30.38 
 
 		 388 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  30.48 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  29.13 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  28.88 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.63 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3031  hypothetical protein  31.54 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.02 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.33 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  26.9 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  28.75 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  30.51 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.51 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  30.3 
 
 		 348 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  26.2 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  29.97 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  28.14 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  27.8 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  27.51 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.17 
 
 		 388 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  29.53 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  27.71 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  28.78 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.36 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0022  hypothetical protein  24.29 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.411446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  25.64 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  29.17 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.53 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  28.19 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  28.19 
 
 		 361 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  28.19 
 
 		 361 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  28.19 
 
 		 361 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  30.51 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  28.19 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  28.19 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  28.19 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  30.51 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  30.51 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  27.8 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  28.35 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  28.03 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  27 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  25.67 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>