More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3228 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  72.28 
 
 		 613 aa  920    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  61.55 
 
 		 623 aa  770    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  55.09 
 
 		 612 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 614 aa  1245    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  67.66 
 
 		 636 aa  874    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  61.88 
 
 		 649 aa  775    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  59.38 
 
 		 617 aa  739    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  55.93 
 
 		 604 aa  653    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  46.24 
 
 		 707 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  45.64 
 
 		 716 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  46.08 
 
 		 707 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  45.93 
 
 		 707 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  44.15 
 
 		 689 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  42.7 
 
 		 624 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  43.44 
 
 		 677 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.95 
 
 		 607 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  43.2 
 
 		 613 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  41.22 
 
 		 588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  41.08 
 
 		 607 aa  442  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  41.85 
 
 		 653 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.92 
 
 		 607 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  40.86 
 
 		 641 aa  435  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 625 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  40.87 
 
 		 614 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 620 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.93 
 
 		 607 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  39.08 
 
 		 620 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  39.27 
 
 		 669 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  40.03 
 
 		 613 aa  425  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 		 609 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 626 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  41.09 
 
 		 636 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  40.68 
 
 		 617 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.85 
 
 		 604 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  40.68 
 
 		 617 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.35 
 
 		 685 aa  415  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  41.19 
 
 		 708 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  39.73 
 
 		 665 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  40.16 
 
 		 607 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.76 
 
 		 601 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 		 615 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.92 
 
 		 591 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 		 598 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  41.15 
 
 		 611 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  38.4 
 
 		 626 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  41.18 
 
 		 590 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 607 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.27 
 
 		 613 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 		 627 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 		 638 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  39.2 
 
 		 622 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  39.22 
 
 		 604 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  39.22 
 
 		 608 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 		 608 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  40.03 
 
 		 596 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 		 611 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  39.38 
 
 		 607 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 		 594 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  38.83 
 
 		 607 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37.69 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 		 624 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  39.22 
 
 		 607 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  39.22 
 
 		 607 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  38.73 
 
 		 656 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.59 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  40.27 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.63 
 
 		 599 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 645 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  40.47 
 
 		 607 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 		 617 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  37.34 
 
 		 625 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  41.35 
 
 		 615 aa  389  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.39 
 
 		 613 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  39.48 
 
 		 607 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 593 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  39.01 
 
 		 628 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 628 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 		 608 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  38.14 
 
 		 622 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  38.77 
 
 		 619 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  39.64 
 
 		 631 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  35.71 
 
 		 666 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  34.87 
 
 		 613 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 		 616 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  38.06 
 
 		 607 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  34.67 
 
 		 644 aa  380  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  38.24 
 
 		 649 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  39.33 
 
 		 657 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 591 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  38.37 
 
 		 693 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>