87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1004 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  343  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  49.32 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  56.47 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  56.47 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  52.33 
 
 		 118 aa  85.1  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  41.88 
 
 		 118 aa  84.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  47.37 
 
 		 116 aa  84.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  47.67 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  39 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  48.84 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  44.32 
 
 		 596 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  42.35 
 
 		 596 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  39.13 
 
 		 583 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  41.18 
 
 		 596 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  37 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  40 
 
 		 589 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  40.48 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  40 
 
 		 596 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  40 
 
 		 596 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  42.86 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  41.67 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  36.73 
 
 		 591 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  40.7 
 
 		 593 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  42.05 
 
 		 598 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  40.48 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  42.05 
 
 		 598 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  37.62 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  42.17 
 
 		 596 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  42.17 
 
 		 596 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  46.34 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 597 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  46.34 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  40.96 
 
 		 596 aa  61.6  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 596 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 596 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 596 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 596 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  34.04 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  37.93 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  45.12 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.79 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  39.33 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  34.41 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.57 
 
 		 588 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.21 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  39.34 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  32.93 
 
 		 589 aa  54.3  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  35.24 
 
 		 116 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  40.24 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  35.23 
 
 		 120 aa  51.2  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  34.09 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  28.97 
 
 		 126 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.69 
 
 		 589 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  35.96 
 
 		 117 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  30.49 
 
 		 116 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  34.26 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  37.97 
 
 		 117 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  37.97 
 
 		 117 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  31.21 
 
 		 333 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  31.21 
 
 		 333 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  31.21 
 
 		 333 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  31.21 
 
 		 333 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  31.21 
 
 		 328 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  34 
 
 		 117 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  37.97 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  36.71 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  37.97 
 
 		 119 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  35.48 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  31.21 
 
 		 329 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  31.21 
 
 		 329 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  30.5 
 
 		 333 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  33 
 
 		 117 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  30.5 
 
 		 333 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  31.43 
 
 		 334 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  30.5 
 
 		 329 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  31.21 
 
 		 329 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  33.78 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  30.5 
 
 		 333 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  29.21 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  30.5 
 
 		 329 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03150  hypothetical protein  34.85 
 
 		 186 aa  42  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0533  hypothetical protein  27.32 
 
 		 222 aa  42  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.738429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  34.62 
 
 		 122 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0527  hypothetical protein  29.29 
 
 		 231 aa  41.2  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.810163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  30.68 
 
 		 123 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>