45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0300 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  100 
 
 		 123 aa  257  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  96.75 
 
 		 123 aa  227  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  82.79 
 
 		 122 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  79.51 
 
 		 122 aa  205  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  87.38 
 
 		 122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  81.13 
 
 		 122 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  37.4 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  34.21 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  29.17 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  30.08 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  31.9 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  31.86 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  32.8 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  33.86 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  31.75 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  32.8 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  33.63 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  35.63 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  36.08 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  28.7 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  35.05 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.83 
 
 		 593 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  29.01 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  29.63 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  27.91 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  28.46 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  27.97 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  35.06 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  27.12 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  31.76 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  26.72 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  28 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  34.48 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  34.94 
 
 		 597 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  34.94 
 
 		 596 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  34.94 
 
 		 596 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  34.94 
 
 		 596 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  30.77 
 
 		 596 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  35.8 
 
 		 589 aa  40.8  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  27.59 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  30.68 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  31.4 
 
 		 589 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.73 
 
 		 596 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  28.95 
 
 		 118 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>