78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0342 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  100 
 
 		 126 aa  265  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  72.22 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  70.87 
 
 		 127 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  70.08 
 
 		 135 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  70.87 
 
 		 127 aa  193  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  76.36 
 
 		 126 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  40.94 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  40.8 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  40.94 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  40.8 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  42.86 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  42.61 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  38.89 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  42.59 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  37.6 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  36.36 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  41.27 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  42.72 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  40.78 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  33.87 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  41.67 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  41.67 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  33.88 
 
 		 596 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  35.54 
 
 		 596 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.54 
 
 		 593 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  33.9 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  32.52 
 
 		 591 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  39.29 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  39.29 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  36.78 
 
 		 598 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  30.16 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.4 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  37.86 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.6 
 
 		 596 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.6 
 
 		 596 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  35.29 
 
 		 598 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  50 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.6 
 
 		 596 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.6 
 
 		 596 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  33.91 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  29.6 
 
 		 597 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.6 
 
 		 596 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.6 
 
 		 596 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.6 
 
 		 596 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 589 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  29.6 
 
 		 596 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  31.4 
 
 		 596 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  30.58 
 
 		 596 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  33.6 
 
 		 589 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  27.64 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  34.78 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.17 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  33.72 
 
 		 596 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  39.71 
 
 		 588 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  28.33 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03150  hypothetical protein  29.36 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  30.36 
 
 		 583 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  29.69 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  32.94 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  30.59 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  32.58 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  35.44 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  31.76 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  31.76 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  29.76 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  29.76 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0527  hypothetical protein  35.58 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.810163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  41.18 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  39.39 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  44.44 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  41.38 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  37.88 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.57 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  32.14 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.593343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>