72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2279 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  100 
 
 		 126 aa  259  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  75.4 
 
 		 126 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  73.02 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  66.93 
 
 		 127 aa  190  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  65.35 
 
 		 135 aa  187  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  64.57 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  41.27 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  43.2 
 
 		 117 aa  87  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  38.89 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  42.28 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  38.1 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  41.13 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  42.4 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  39.2 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  36.59 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  40.19 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  39.58 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  39 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  37.38 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  40 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  36.15 
 
 		 596 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  39.52 
 
 		 596 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  37.9 
 
 		 596 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  33.07 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  35.48 
 
 		 596 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  40.48 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.43 
 
 		 593 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  30.4 
 
 		 588 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  29.6 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  43.53 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  36.9 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  30.51 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  32.52 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  40.7 
 
 		 583 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  35 
 
 		 589 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  36.46 
 
 		 596 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  34.21 
 
 		 598 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  34.95 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  29.37 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  38.64 
 
 		 591 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.5 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.69 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.69 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  28.69 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  28.69 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  35.96 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  28.69 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  28.69 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  30 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  39.29 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.69 
 
 		 596 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  37.04 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.69 
 
 		 597 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.69 
 
 		 596 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  32.71 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.57 
 
 		 589 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  31.9 
 
 		 598 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  28.21 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03150  hypothetical protein  29.91 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  32.22 
 
 		 589 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  32.98 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.23 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  33.72 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  30.43 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  28.35 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  28.85 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  40 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  34.48 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  33.72 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  30.95 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  33.33 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>