42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1413 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  100 
 
 		 123 aa  258  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  96.75 
 
 		 123 aa  227  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  81.15 
 
 		 122 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  81.97 
 
 		 122 aa  209  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  88.35 
 
 		 122 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  83.96 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  34.96 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  34.21 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  31.03 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  31.9 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  31.86 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  29.27 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  30.25 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  30.25 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  34.51 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  35.63 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  30.16 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  28.7 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  31.5 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  31.87 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  30.77 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  28.68 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  30.43 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  31.78 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  26.92 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  27.97 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  35.06 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  27.59 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30 
 
 		 593 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  26.27 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  31.76 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  28 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  34.94 
 
 		 596 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  34.94 
 
 		 596 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  33.33 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  34.94 
 
 		 596 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  34.94 
 
 		 597 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  27.59 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  28.95 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.73 
 
 		 596 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  29.32 
 
 		 596 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>