47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0275 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  100 
 
 		 122 aa  253  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  88.99 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  77.87 
 
 		 122 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  86.89 
 
 		 122 aa  205  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  86.24 
 
 		 123 aa  203  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  81.15 
 
 		 122 aa  199  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  35.83 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  32.17 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  32.5 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  31.15 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  30.97 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  29.41 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  32.1 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  33.05 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  28.81 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  28.93 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  34.48 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  34.57 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  28.69 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  30.43 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  27.82 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  29.21 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  30.3 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.94 
 
 		 593 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  34.17 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  29.77 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  24.78 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  24.65 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  33.73 
 
 		 596 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.73 
 
 		 596 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  33.73 
 
 		 597 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  33.73 
 
 		 596 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  32.56 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  33.73 
 
 		 596 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  29.76 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  24.78 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  32.53 
 
 		 596 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  32.53 
 
 		 596 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  32.53 
 
 		 596 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  32.53 
 
 		 596 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  27.97 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  33.72 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  31.25 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  25.42 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  35.92 
 
 		 589 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  28.74 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  35.38 
 
 		 266 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>