75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1491 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  100 
 
 
127 aa  265  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  88.19 
 
 
127 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  77.95 
 
 
135 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  70.08 
 
 
126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  76.15 
 
 
126 aa  183  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  72.48 
 
 
126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  39.68 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  42.62 
 
 
117 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  40.8 
 
 
117 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  38.4 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  39.68 
 
 
117 aa  83.6  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  36.51 
 
 
116 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  37.8 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  37.8 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  36.72 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  42.16 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  37.61 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  32.54 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  40.78 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  45.24 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  34.56 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  41.67 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  33.62 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.13 
 
 
593 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  30.71 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.1 
 
 
122 aa  60.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  35.77 
 
 
591 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  30.16 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  34.65 
 
 
596 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  34.15 
 
 
596 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  36.07 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  35.23 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  33.86 
 
 
596 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  40.48 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  38.89 
 
 
589 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.39 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  33.05 
 
 
596 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  34.09 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  40.66 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  31.36 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  33.01 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  31.78 
 
 
589 aa  55.1  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  39.33 
 
 
588 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  29.63 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  37.93 
 
 
596 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  33.88 
 
 
596 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  33.88 
 
 
596 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  33.06 
 
 
597 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  33.06 
 
 
596 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  37.93 
 
 
598 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  39.08 
 
 
598 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  31.4 
 
 
596 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  31.4 
 
 
596 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  31.4 
 
 
596 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  31.4 
 
 
596 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  29.82 
 
 
583 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  32.76 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  33.72 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.23 
 
 
596 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  33.72 
 
 
122 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  37.35 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  32.56 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  32.14 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  32.56 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  32.5 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  28.07 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  46.77 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  40.86 
 
 
221 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  33.59 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.79 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03150  hypothetical protein  33.85 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  37.93 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  39.68 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  36.56 
 
 
221 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>