65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2229 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  100 
 
 		 117 aa  243  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  99.15 
 
 		 117 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  94.87 
 
 		 117 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  77.78 
 
 		 117 aa  202  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  76.92 
 
 		 117 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  79.49 
 
 		 117 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  78.99 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  84.48 
 
 		 117 aa  190  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  81 
 
 		 101 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  51.72 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  46.55 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  37.3 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  41.07 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  37.8 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  38.58 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  36.22 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  38.89 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  40.96 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  36.7 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  36.61 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  33.06 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  31.78 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  36.84 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  36.61 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  31.09 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  42.17 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  37.39 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  30.19 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  31.54 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  31.73 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  38.75 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  29.52 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  34.55 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  29.91 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  35 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  28.7 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  32.98 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  32 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  27.35 
 
 		 596 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  29.7 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.81 
 
 		 596 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.77 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  29.84 
 
 		 596 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.81 
 
 		 596 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.81 
 
 		 596 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.81 
 
 		 597 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.81 
 
 		 596 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.89 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.59 
 
 		 596 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  37.97 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.05 
 
 		 596 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  27.05 
 
 		 596 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.05 
 
 		 596 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.05 
 
 		 596 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  32.5 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  34.82 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  25.42 
 
 		 596 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  31.62 
 
 		 588 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  30.09 
 
 		 589 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  29.73 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  25.23 
 
 		 583 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  32.95 
 
 		 591 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.89 
 
 		 593 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  29.17 
 
 		 181 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.73 
 
 		 114 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>