61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0297 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  100 
 
 		 112 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  36.94 
 
 		 591 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  37.78 
 
 		 596 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  32.17 
 
 		 588 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.53 
 
 		 593 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  36.67 
 
 		 598 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  35.29 
 
 		 589 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  33.05 
 
 		 589 aa  67  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  33.04 
 
 		 596 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.28 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  33.68 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  37.04 
 
 		 596 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 596 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 597 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 596 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 596 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  36.67 
 
 		 598 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.89 
 
 		 596 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.57 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  36 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  33.33 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  44.07 
 
 		 596 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  30.25 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  35.14 
 
 		 583 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  33.04 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  27.5 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  34.09 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  27.5 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  31.82 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  32.46 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  36 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  29 
 
 		 589 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  32.67 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  52.63 
 
 		 232 aa  48.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  32.67 
 
 		 221 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  31.46 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  28.71 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  33.7 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2333  cytochrome c3  30.63 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.318001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1793  cytochrome c3  30.36 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  28.07 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1830  cytochrome c3  30.36 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.428734  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2492  cytochrome c3  30.36 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1786  cytochrome c3  30.36 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.790762  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2511  cytochrome c3  30.63 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000190498  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2388  cytochrome c3  30.63 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.213014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2318  cytochrome c3  30.63 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2727  cytochrome c3  30.63 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  30.1 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04960  hypothetical protein  51.61 
 
 		 240 aa  42.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1005  hypothetical protein  28.7 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.289863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  26.79 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  32.46 
 
 		 186 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  29.17 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>