34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1005 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1005  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  360  5.0000000000000005e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.289863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  48.19 
 
 		 232 aa  192  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  47.92 
 
 		 216 aa  185  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04960  hypothetical protein  40.23 
 
 		 240 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07630  hypothetical protein  40.33 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13410  hypothetical protein  36.84 
 
 		 261 aa  128  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  46.05 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  32.08 
 
 		 596 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  33.93 
 
 		 596 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  39.39 
 
 		 596 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  29.41 
 
 		 591 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  29.91 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  30.84 
 
 		 583 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  37.88 
 
 		 596 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.7 
 
 		 598 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  42.65 
 
 		 596 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  42.65 
 
 		 596 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  36.36 
 
 		 596 aa  45.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  41.18 
 
 		 596 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  41.18 
 
 		 596 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  41.18 
 
 		 596 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  41.18 
 
 		 596 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  28.7 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  41.18 
 
 		 596 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  41.18 
 
 		 597 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  39.13 
 
 		 596 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  27.59 
 
 		 589 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.96 
 
 		 598 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  30.36 
 
 		 150 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  37.97 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  33.64 
 
 		 221 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.93 
 
 		 589 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  29.2 
 
 		 114 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  42.86 
 
 		 119 aa  41.2  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>