60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2097 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  298  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  89.71 
 
 
221 aa  248  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  88.24 
 
 
221 aa  243  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  43.09 
 
 
591 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  40.43 
 
 
596 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  41.35 
 
 
589 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  38 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  40.22 
 
 
598 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  37.5 
 
 
589 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  39.22 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  37.23 
 
 
588 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  41.05 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  39.13 
 
 
598 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  50.6 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  50.6 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  35.05 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  41.46 
 
 
596 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  38.61 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.04 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  45.12 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  41.35 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.81 
 
 
593 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  34.29 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.33 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  39.02 
 
 
596 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  40.24 
 
 
583 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  39.02 
 
 
596 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  32.28 
 
 
182 aa  54.7  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  37.8 
 
 
596 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  35.09 
 
 
596 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  35.09 
 
 
596 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  34.78 
 
 
596 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  34.78 
 
 
596 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  35.09 
 
 
597 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  34.78 
 
 
596 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  34.78 
 
 
596 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  35.09 
 
 
596 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  29.5 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35.09 
 
 
596 aa  50.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  36.67 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.71 
 
 
589 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  36 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  43.75 
 
 
232 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  42.19 
 
 
216 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  37.21 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  33.63 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  30 
 
 
363 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07630  hypothetical protein  32.79 
 
 
229 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  30.53 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  39.76 
 
 
127 aa  42.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  37.93 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  40 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  43.28 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  32.56 
 
 
120 aa  42  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  38.46 
 
 
125 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1005  hypothetical protein  31.78 
 
 
172 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.289863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1825  cytochrome c3  30.53 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.870052  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  36.36 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>