40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2528 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  91.75 
 
 
232 aa  390  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04960  hypothetical protein  58.5 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07630  hypothetical protein  59.05 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13410  hypothetical protein  48.17 
 
 
261 aa  189  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1005  hypothetical protein  47.93 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.289863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  43.37 
 
 
186 aa  122  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  34.59 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.79 
 
 
598 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  29.55 
 
 
598 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  41.1 
 
 
591 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  40.98 
 
 
596 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  42.11 
 
 
588 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  34.78 
 
 
589 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  42.19 
 
 
150 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  45.1 
 
 
596 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  45.1 
 
 
596 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  36.54 
 
 
589 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  28.39 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  41.1 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  51.35 
 
 
112 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  43.14 
 
 
596 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35.48 
 
 
114 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  43.14 
 
 
596 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  43.14 
 
 
596 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  43.14 
 
 
596 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  43.14 
 
 
597 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  43.14 
 
 
596 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  43.14 
 
 
596 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  29.6 
 
 
114 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0987  flavocytochrome c  37.33 
 
 
148 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.11 
 
 
122 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  37.25 
 
 
596 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  29.27 
 
 
136 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  39.22 
 
 
583 aa  42.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  39.74 
 
 
126 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  39.22 
 
 
596 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  39.39 
 
 
126 aa  42  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  37.25 
 
 
596 aa  41.6  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>