72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0942 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  58.33 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  58.33 
 
 		 137 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  49.44 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  46.07 
 
 		 118 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  41.24 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  42.22 
 
 		 113 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  40.57 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  45.24 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  44.05 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  41.67 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  40.48 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  40.48 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  42.17 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  40.23 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  42.17 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  39.36 
 
 		 118 aa  62  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  41.46 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  42.17 
 
 		 117 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  39.76 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  39.76 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  38.55 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  43.43 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  41.46 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  40.26 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  35 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  43.43 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  32.98 
 
 		 122 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  35.06 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  37.66 
 
 		 120 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  32.22 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  38.55 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  41.67 
 
 		 591 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  32.65 
 
 		 589 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  33.75 
 
 		 588 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  34.09 
 
 		 596 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  31.48 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.69 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  35.8 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  38.16 
 
 		 122 aa  48.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  31.46 
 
 		 112 aa  47.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  29.25 
 
 		 596 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  28.1 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  35.87 
 
 		 598 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  32.53 
 
 		 596 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  32.93 
 
 		 596 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  29.25 
 
 		 596 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  30.12 
 
 		 596 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  30.12 
 
 		 596 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  30.12 
 
 		 596 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  25.31 
 
 		 757 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  30.12 
 
 		 596 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  30.49 
 
 		 596 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  29.25 
 
 		 583 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  34.78 
 
 		 598 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  30.49 
 
 		 597 aa  44.7  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  28.42 
 
 		 126 aa  44.3  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.46 
 
 		 596 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.46 
 
 		 596 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.27 
 
 		 596 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.12 
 
 		 593 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0533  hypothetical protein  28.26 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.738429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  30.38 
 
 		 122 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  31.65 
 
 		 116 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  32.58 
 
 		 566 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.71 
 
 		 122 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  29.25 
 
 		 182 aa  40.8  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  32.89 
 
 		 589 aa  41.2  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0527  hypothetical protein  27.54 
 
 		 231 aa  40.8  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.810163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  34.62 
 
 		 122 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>