68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0887 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  284  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  40.19 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  36.11 
 
 
588 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  32.54 
 
 
591 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  39.42 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  40.37 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  38.32 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.19 
 
 
593 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  37.35 
 
 
596 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  39.08 
 
 
596 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  39.08 
 
 
596 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  36.73 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  37.93 
 
 
597 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  35.4 
 
 
596 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.93 
 
 
596 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  36.47 
 
 
596 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  37.93 
 
 
596 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  37.5 
 
 
596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  37.5 
 
 
596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  37.5 
 
 
596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  37.5 
 
 
596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  35.71 
 
 
221 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  41.56 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  34.31 
 
 
596 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  39.34 
 
 
589 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  37.35 
 
 
598 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  35.05 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  34.74 
 
 
583 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  34.94 
 
 
598 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  31.78 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.62 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.67 
 
 
589 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.66 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  36.26 
 
 
589 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  33.63 
 
 
596 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  28.57 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  39.24 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  32.73 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  38.55 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  32.76 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  37.97 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  36.59 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  29.41 
 
 
126 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  30.49 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  34.29 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  32.08 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  29.73 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  34.82 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  30.19 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  35.79 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  34.82 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  32.98 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  28.68 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  33.78 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  36.36 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  36.51 
 
 
232 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  34.78 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  31.19 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  29.73 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  29.27 
 
 
216 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  30.84 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  30.1 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  27.88 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13410  hypothetical protein  38.78 
 
 
261 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  30.28 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  34.12 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>