40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2727 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2727  cytochrome c3  100 
 
 		 116 aa  234  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2492  cytochrome c3  93.1 
 
 		 116 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1786  cytochrome c3  93.1 
 
 		 116 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.790762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1830  cytochrome c3  93.1 
 
 		 116 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.428734  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1793  cytochrome c3  93.1 
 
 		 116 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2318  cytochrome c3  94.83 
 
 		 116 aa  222  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2388  cytochrome c3  94.83 
 
 		 116 aa  222  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.213014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2511  cytochrome c3  93.1 
 
 		 116 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000190498  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2333  cytochrome c3  91.38 
 
 		 116 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.318001  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1871  cytochrome c3  72.17 
 
 		 124 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474787  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1444  cytochrome c3  77.59 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000119366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  65.45 
 
 		 111 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2769  cytochrome c3  73.91 
 
 		 115 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149845  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1724  cytochrome c3  73.28 
 
 		 116 aa  146  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000750821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1806  cytochrome c3  72.17 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.021611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0244  hypothetical protein  50.56 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3964  hypothetical protein  46.67 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  40.74 
 
 		 596 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  40.74 
 
 		 596 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  40.74 
 
 		 596 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  40.74 
 
 		 597 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  39.81 
 
 		 596 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1825  cytochrome c3  42.39 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.870052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  39.81 
 
 		 596 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  39.81 
 
 		 596 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  39.81 
 
 		 596 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  39.81 
 
 		 596 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.44 
 
 		 593 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0515  hypothetical protein  37.78 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  41.23 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  37.39 
 
 		 596 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  36.36 
 
 		 596 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  37.25 
 
 		 596 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  35.96 
 
 		 589 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.91 
 
 		 588 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  36.54 
 
 		 583 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.65 
 
 		 589 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.13 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  30.63 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  30.97 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>