42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1825 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1825  cytochrome c3  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.870052  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3964  hypothetical protein  55.21 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0244  hypothetical protein  48.96 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0515  hypothetical protein  43.75 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2492  cytochrome c3  43.48 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1830  cytochrome c3  43.48 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.428734  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2318  cytochrome c3  43.48 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2388  cytochrome c3  43.48 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.213014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1786  cytochrome c3  43.48 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.790762  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2511  cytochrome c3  43.48 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000190498  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1793  cytochrome c3  43.48 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2333  cytochrome c3  42.39 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.318001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2727  cytochrome c3  42.39 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1444  cytochrome c3  44.16 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000119366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  40.86 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1871  cytochrome c3  40.66 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474787  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1806  cytochrome c3  45.33 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.021611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2769  cytochrome c3  42.67 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149845  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  36.89 
 
 		 597 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  38.83 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.89 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  38.83 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  38.83 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  38.83 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  36.89 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  40.91 
 
 		 593 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  36.89 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  36.89 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1724  cytochrome c3  40.79 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000750821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  36.27 
 
 		 596 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  40 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  38.27 
 
 		 589 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  38.04 
 
 		 596 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  35.29 
 
 		 588 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  36.63 
 
 		 596 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  34.48 
 
 		 583 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  29.81 
 
 		 591 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.33 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  30.53 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  31.33 
 
 		 596 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.07 
 
 		 589 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  30.53 
 
 		 221 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>