40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2769 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2769  cytochrome c3  100 
 
 		 115 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149845  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1871  cytochrome c3  93.04 
 
 		 124 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474787  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2511  cytochrome c3  77.39 
 
 		 116 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000190498  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2318  cytochrome c3  76.52 
 
 		 116 aa  187  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2388  cytochrome c3  76.52 
 
 		 116 aa  187  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.213014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1830  cytochrome c3  74.78 
 
 		 116 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.428734  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1786  cytochrome c3  74.78 
 
 		 116 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2492  cytochrome c3  74.78 
 
 		 116 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1793  cytochrome c3  74.78 
 
 		 116 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2727  cytochrome c3  73.91 
 
 		 116 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2333  cytochrome c3  73.91 
 
 		 116 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.318001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1724  cytochrome c3  89.57 
 
 		 116 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000750821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1806  cytochrome c3  86.09 
 
 		 124 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.021611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  69.37 
 
 		 111 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1444  cytochrome c3  73.04 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000119366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0244  hypothetical protein  47.42 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3964  hypothetical protein  47.31 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0515  hypothetical protein  43.14 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1825  cytochrome c3  40.66 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.870052  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.75 
 
 		 593 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  38.6 
 
 		 596 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  37.84 
 
 		 596 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  32.65 
 
 		 589 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  34.91 
 
 		 596 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  34.91 
 
 		 596 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  34.91 
 
 		 597 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  34.91 
 
 		 596 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.91 
 
 		 596 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  42.05 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  37.5 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  40.91 
 
 		 583 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  35.85 
 
 		 596 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  35.85 
 
 		 596 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  35.85 
 
 		 596 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  35.85 
 
 		 596 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.31 
 
 		 588 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.68 
 
 		 589 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  29.73 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  31.87 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  30.56 
 
 		 785 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>