38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1724 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1724  cytochrome c3  100 
 
 		 116 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000750821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1871  cytochrome c3  86.09 
 
 		 124 aa  206  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474787  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2318  cytochrome c3  77.59 
 
 		 116 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2388  cytochrome c3  77.59 
 
 		 116 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.213014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2511  cytochrome c3  75.86 
 
 		 116 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000190498  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1786  cytochrome c3  74.14 
 
 		 116 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2492  cytochrome c3  74.14 
 
 		 116 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1830  cytochrome c3  74.14 
 
 		 116 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.428734  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1793  cytochrome c3  74.14 
 
 		 116 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2333  cytochrome c3  74.14 
 
 		 116 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.318001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2727  cytochrome c3  73.28 
 
 		 116 aa  177  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2769  cytochrome c3  89.57 
 
 		 115 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149845  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1806  cytochrome c3  85.22 
 
 		 124 aa  169  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.021611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  70.91 
 
 		 111 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1444  cytochrome c3  78.65 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000119366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3964  hypothetical protein  46.24 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0244  hypothetical protein  44.33 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0515  hypothetical protein  45.1 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  37.74 
 
 		 597 aa  62  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  37.74 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  37.74 
 
 		 596 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  37.74 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.74 
 
 		 596 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1825  cytochrome c3  38.04 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.870052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  38.68 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  38.68 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  38.68 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  38.68 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  37.5 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  35.29 
 
 		 588 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  41.86 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  38.37 
 
 		 596 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  35.14 
 
 		 596 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.36 
 
 		 593 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  39.77 
 
 		 583 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  30.61 
 
 		 589 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.66 
 
 		 589 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  29.46 
 
 		 112 aa  42  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>