40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0244 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0244  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  189  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3964  hypothetical protein  61.46 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0515  hypothetical protein  52.08 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1825  cytochrome c3  48.96 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.870052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2333  cytochrome c3  52.81 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.318001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1786  cytochrome c3  51.69 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2492  cytochrome c3  51.69 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  50 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1830  cytochrome c3  51.69 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.428734  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1793  cytochrome c3  51.69 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1871  cytochrome c3  52.63 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474787  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2727  cytochrome c3  50.56 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2511  cytochrome c3  50.56 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000190498  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2388  cytochrome c3  50.56 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.213014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2318  cytochrome c3  50.56 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2769  cytochrome c3  56.58 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149845  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1806  cytochrome c3  55.26 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.021611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1724  cytochrome c3  52.63 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000750821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1444  cytochrome c3  51.32 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000119366  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.74 
 
 		 596 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  36.79 
 
 		 596 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  36.79 
 
 		 597 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  36.79 
 
 		 596 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  36.79 
 
 		 596 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  38.68 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  38.68 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  38.68 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  35.51 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  38.68 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.31 
 
 		 588 aa  59.3  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  36.26 
 
 		 583 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  38.89 
 
 		 596 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  37.35 
 
 		 589 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  39.42 
 
 		 593 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  35.58 
 
 		 596 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  38.3 
 
 		 596 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  28.7 
 
 		 591 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  32.46 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.56 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  36 
 
 		 349 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>