76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0137 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  40.35 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  36.23 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  40 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.33 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  32.54 
 
 
589 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  36.25 
 
 
596 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  27.27 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  35 
 
 
596 aa  57.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  28.89 
 
 
221 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  35.79 
 
 
165 aa  57.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  31.62 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  35 
 
 
583 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  35 
 
 
596 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  35 
 
 
596 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  34.83 
 
 
221 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  35.29 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  34.09 
 
 
596 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  36.25 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  35 
 
 
172 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  30.43 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  33.04 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.91 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.52 
 
 
588 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  32.5 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  34.94 
 
 
598 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.62 
 
 
593 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  33.93 
 
 
113 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  33.06 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  32.1 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  32.53 
 
 
598 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  32.52 
 
 
117 aa  48.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  30.89 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  29.81 
 
 
577 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  34.57 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.46 
 
 
591 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.95 
 
 
596 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  32.95 
 
 
596 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  32.95 
 
 
596 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  32.95 
 
 
597 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.95 
 
 
596 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0345  hypothetical protein  26.09 
 
 
644 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  29.09 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  31.82 
 
 
596 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2511  cytochrome c3  30 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000190498  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  31.82 
 
 
596 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  31.82 
 
 
596 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  31.82 
 
 
596 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0299  hypothetical protein  25.45 
 
 
627 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.89 
 
 
589 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2318  cytochrome c3  30 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1793  cytochrome c3  30 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1830  cytochrome c3  30 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.428734  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2388  cytochrome c3  30 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.213014  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2492  cytochrome c3  30 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129247  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2333  cytochrome c3  30 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.318001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1786  cytochrome c3  30 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  27.88 
 
 
540 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  29.69 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2727  cytochrome c3  29.13 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  28.79 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  34 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  31.4 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  27.87 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  48.48 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  31.9 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  36.05 
 
 
117 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.1 
 
 
589 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  28.03 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3964  hypothetical protein  27.1 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  27.73 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1871  cytochrome c3  24.76 
 
 
124 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474787  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  32.95 
 
 
116 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  30.77 
 
 
135 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>