73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1247 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1247  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 512 aa  1050    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  30.21 
 
 		 422 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  30.39 
 
 		 396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  30.16 
 
 		 422 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  29.7 
 
 		 422 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4366  carbohydrate-selective porin OprB  28.3 
 
 		 448 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00370105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2711  carbohydrate-selective porin OprB  30.73 
 
 		 417 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.695739  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1632  putative porin B precursor outer (glucose porin) transmembrane protein  27.86 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  27.55 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  27.38 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  27.38 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3835  Carbohydrate-selective porin OprB  28.74 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.899229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4912  Carbohydrate-selective porin OprB  28.74 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00363735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  26.74 
 
 		 447 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1190  Carbohydrate-selective porin OprB  30.53 
 
 		 501 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  27.27 
 
 		 452 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  27.97 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  27.17 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  27.27 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  27.97 
 
 		 454 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1331  carbohydrate-selective porin OprB  29.77 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901069  hitchhiker  0.00588319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1296  porin B  26.46 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  25.7 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  25.24 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00490  regulator of pathogenicity factors  28.43 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4276  carbohydrate-selective porin OprB  25.47 
 
 		 444 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01615  regulator of pathogenicity factors  27.06 
 
 		 440 aa  120  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00130056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1445  porin B  25 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  25 
 
 		 444 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2033  Carbohydrate-selective porin OprB  27.93 
 
 		 417 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1115  Carbohydrate-selective porin OprB  22.36 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967056  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4200  Carbohydrate-selective porin OprB  24.88 
 
 		 482 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3070  carbohydrate-selective porin OprB  22.69 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.681986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2838  carbohydrate-selective porin OprB  22.69 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2860  carbohydrate-selective porin OprB  22.69 
 
 		 454 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00385913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0854  Carbohydrate-selective porin OprB  25.7 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.648225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1821  Carbohydrate-selective porin OprB  24.71 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5436  carbohydrate-selective porin, OprB family  24.55 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390026  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  23.43 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2869  Carbohydrate-selective porin OprB  21.49 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3629  carbohydrate-selective porin OprB  25.52 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419401  decreased coverage  0.00176786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4737  Carbohydrate-selective porin OprB  24.34 
 
 		 502 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4227  carbohydrate-selective porin OprB  22.57 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796044  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1384  carbohydrate-selective porin OprB  23.97 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1762  Carbohydrate-selective porin OprB  24.58 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2070  carbohydrate porin  24.62 
 
 		 504 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3023  carbohydrate porin  24.62 
 
 		 504 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0489  carbohydrate porin  24.62 
 
 		 504 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0296  carbohydrate porin  24.62 
 
 		 504 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2652  carbohydrate porin  24.62 
 
 		 504 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.486905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3354  carbohydrate porin  24.62 
 
 		 504 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0309  carbohydrate porin  24.62 
 
 		 504 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19511  hypothetical protein  21.88 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1659  Carbohydrate-selective porin OprB  23.73 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4759  carbohydrate-selective porin OprB  22.76 
 
 		 494 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.15964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0267  carbohydrate porin  23.03 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3558  carbohydrate-selective porin OprB  22.2 
 
 		 534 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1380  Carbohydrate-selective porin OprB  21.63 
 
 		 522 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.768391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0812  carbohydrate-selective porin OprB  32.85 
 
 		 268 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2383  hypothetical protein  30.53 
 
 		 167 aa  50.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4236  carbohydrate-selective porin OprB  21.65 
 
 		 492 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.269576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2969  carbohydrate-selective porin OprB  25.08 
 
 		 480 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2528  Carbohydrate-selective porin OprB  22.27 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2156  carbohydrate-selective porin OprB  23.78 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1735  carbohydrate-selective porin OprB  20.82 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2894  Carbohydrate-selective porin OprB  21.8 
 
 		 509 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4831  Carbohydrate-selective porin OprB  20.98 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0156749  normal  0.100608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0870  carbohydrate-selective porin OprB  23.02 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  hitchhiker  0.00100235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2771  carbohydrate-selective porin OprB  21.9 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3953  carbohydrate-selective porin OprB  22.25 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268403  normal  0.112791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3503  carbohydrate-selective porin OprB  25.93 
 
 		 514 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4863  carbohydrate-selective porin OprB  25.93 
 
 		 514 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2998  Carbohydrate-selective porin OprB  21.67 
 
 		 534 aa  43.9  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0740005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>