48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_19511 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_19511  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  926    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  25.91 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1331  carbohydrate-selective porin OprB  25.38 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901069  hitchhiker  0.00588319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  25.91 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  25.91 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  25.45 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  25.98 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  26.21 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  25.98 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  25.93 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  25.06 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1190  Carbohydrate-selective porin OprB  23.94 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  24.17 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1296  porin B  23.87 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  25 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4366  carbohydrate-selective porin OprB  23.3 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00370105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4276  carbohydrate-selective porin OprB  23.93 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1445  porin B  24.32 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  24.88 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4200  Carbohydrate-selective porin OprB  22.03 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2711  carbohydrate-selective porin OprB  24.01 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.695739  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3070  carbohydrate-selective porin OprB  21.13 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.681986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2838  carbohydrate-selective porin OprB  21.13 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3835  Carbohydrate-selective porin OprB  27.09 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.899229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4912  Carbohydrate-selective porin OprB  27.09 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00363735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  25.24 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  25.42 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2860  carbohydrate-selective porin OprB  20.8 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00385913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2033  Carbohydrate-selective porin OprB  24.42 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1632  putative porin B precursor outer (glucose porin) transmembrane protein  25.62 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1115  Carbohydrate-selective porin OprB  22.25 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967056  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1247  Carbohydrate-selective porin OprB  21.88 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00490  regulator of pathogenicity factors  22.49 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1762  Carbohydrate-selective porin OprB  24.48 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1380  Carbohydrate-selective porin OprB  24.94 
 
 		 522 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.768391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2869  Carbohydrate-selective porin OprB  22.08 
 
 		 490 aa  53.5  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01615  regulator of pathogenicity factors  21.79 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00130056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0854  Carbohydrate-selective porin OprB  21.04 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.648225 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3768  Carbohydrate-selective porin OprB  29.75 
 
 		 476 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3661  Carbohydrate-selective porin OprB  28.93 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  24.58 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  23.57 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5436  carbohydrate-selective porin, OprB family  23.57 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390026  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  23.04 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1659  Carbohydrate-selective porin OprB  24.34 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2969  carbohydrate-selective porin OprB  21.43 
 
 		 480 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0852  carbohydrate-selective porin OprB  24.89 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3271  hypothetical protein  41.67 
 
 		 469 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>