93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1762 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1762  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 446 aa  891    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4227  carbohydrate-selective porin OprB  66.52 
 
 		 498 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796044  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4737  Carbohydrate-selective porin OprB  65.19 
 
 		 502 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100904  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2771  carbohydrate-selective porin OprB  58.39 
 
 		 534 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1380  Carbohydrate-selective porin OprB  58.52 
 
 		 522 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.768391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2894  Carbohydrate-selective porin OprB  57.72 
 
 		 509 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1384  carbohydrate-selective porin OprB  58.74 
 
 		 490 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2998  Carbohydrate-selective porin OprB  58.39 
 
 		 534 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1659  Carbohydrate-selective porin OprB  58.52 
 
 		 490 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0870  carbohydrate-selective porin OprB  59.19 
 
 		 481 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  hitchhiker  0.00100235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  46.38 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2969  carbohydrate-selective porin OprB  43.85 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1735  carbohydrate-selective porin OprB  42.82 
 
 		 449 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1063  Carbohydrate-selective porin OprB  44.12 
 
 		 473 aa  342  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.659002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3629  carbohydrate-selective porin OprB  40.78 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419401  decreased coverage  0.00176786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0267  carbohydrate porin  38.88 
 
 		 514 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0309  carbohydrate porin  37.84 
 
 		 504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3354  carbohydrate porin  37.84 
 
 		 504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0489  carbohydrate porin  37.84 
 
 		 504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3023  carbohydrate porin  37.84 
 
 		 504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2652  carbohydrate porin  37.84 
 
 		 504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.486905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2070  carbohydrate porin  37.84 
 
 		 504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0296  carbohydrate porin  37.84 
 
 		 504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3503  carbohydrate-selective porin OprB  37.24 
 
 		 514 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4863  carbohydrate-selective porin OprB  37.24 
 
 		 514 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4759  carbohydrate-selective porin OprB  36.36 
 
 		 494 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.15964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5422  carbohydrate-selective porin OprB  37 
 
 		 493 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585602  normal  0.389505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4236  carbohydrate-selective porin OprB  36.38 
 
 		 492 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.269576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0852  carbohydrate-selective porin OprB  36.3 
 
 		 495 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942997 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4004  carbohydrate-selective porin OprB  38.17 
 
 		 483 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3558  carbohydrate-selective porin OprB  36.55 
 
 		 534 aa  270  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2528  Carbohydrate-selective porin OprB  38.32 
 
 		 502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2156  carbohydrate-selective porin OprB  37.06 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3953  carbohydrate-selective porin OprB  36.69 
 
 		 488 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268403  normal  0.112791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4831  Carbohydrate-selective porin OprB  35.51 
 
 		 507 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0156749  normal  0.100608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1832  carbohydrate porin  36.19 
 
 		 474 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.378247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1597  carbohydrate-selective porin OprB  30.96 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0966255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1331  carbohydrate-selective porin OprB  31.65 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901069  hitchhiker  0.00588319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01615  regulator of pathogenicity factors  26.17 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00130056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1190  Carbohydrate-selective porin OprB  27.54 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4912  Carbohydrate-selective porin OprB  27.23 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00363735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  24.72 
 
 		 452 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3835  Carbohydrate-selective porin OprB  27.23 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.899229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  24.26 
 
 		 454 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  25.54 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  24.04 
 
 		 454 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  24.04 
 
 		 452 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1632  putative porin B precursor outer (glucose porin) transmembrane protein  27.48 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  24.94 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  24.94 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  24.94 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  26.29 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4276  carbohydrate-selective porin OprB  23.95 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  27.17 
 
 		 396 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  28.14 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  26.29 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00490  regulator of pathogenicity factors  24.88 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  24.04 
 
 		 448 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  24.54 
 
 		 447 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2711  carbohydrate-selective porin OprB  26.94 
 
 		 417 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.695739  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  23.49 
 
 		 453 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2150  Carbohydrate-selective porin OprB  28.1 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000322479  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2033  Carbohydrate-selective porin OprB  26.96 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2522  carbohydrate-selective porin, OprB family  28.1 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0118751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1771  Carbohydrate-selective porin OprB  30.67 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.799068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1445  porin B  23.54 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  23.27 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4366  carbohydrate-selective porin OprB  24.56 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00370105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1296  porin B  22.84 
 
 		 453 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4200  Carbohydrate-selective porin OprB  25.88 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2178  carbohydrate-selective porin OprB  27.09 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278032  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0854  Carbohydrate-selective porin OprB  25 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.648225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1115  Carbohydrate-selective porin OprB  25.88 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967056  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3047  carbohydrate-selective porin OprB  28.97 
 
 		 391 aa  83.2  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.854363  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2869  Carbohydrate-selective porin OprB  24.78 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0154  Carbohydrate-selective porin OprB  25.85 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.858222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5436  carbohydrate-selective porin, OprB family  25.34 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390026  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2860  carbohydrate-selective porin OprB  23.31 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00385913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3070  carbohydrate-selective porin OprB  23.31 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.681986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2838  carbohydrate-selective porin OprB  23.31 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1247  Carbohydrate-selective porin OprB  24.58 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1821  Carbohydrate-selective porin OprB  23.1 
 
 		 486 aa  69.7  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2250  carbohydrate-selective porin, OprB family  25.07 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1898  Carbohydrate-selective porin OprB  25.07 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.541333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1477  Carbohydrate-selective porin OprB  27.08 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19511  hypothetical protein  23.15 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2751  carbohydrate-selective porin OprB  24.51 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.202947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  27.46 
 
 		 710 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0812  carbohydrate-selective porin OprB  27.44 
 
 		 268 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4992  Carbohydrate-selective porin OprB  33.02 
 
 		 498 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000230615  hitchhiker  0.00966153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1095  Carbohydrate-selective porin OprB  24.68 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0806614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1590  Carbohydrate-selective porin OprB  27.4 
 
 		 476 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3166  Carbohydrate-selective porin OprB  28.92 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  hitchhiker  0.000000000149961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>