45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0812 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0812  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 268 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4102  Carbohydrate-selective porin OprB  36.17 
 
 		 522 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.792226  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1477  Carbohydrate-selective porin OprB  29.97 
 
 		 462 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1095  Carbohydrate-selective porin OprB  30.51 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0806614  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1832  carbohydrate porin  33.12 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.378247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4831  Carbohydrate-selective porin OprB  29.94 
 
 		 507 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0156749  normal  0.100608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3953  carbohydrate-selective porin OprB  29.7 
 
 		 488 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268403  normal  0.112791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2156  carbohydrate-selective porin OprB  26.9 
 
 		 478 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2969  carbohydrate-selective porin OprB  25.13 
 
 		 480 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4759  carbohydrate-selective porin OprB  29.37 
 
 		 494 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.15964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4236  carbohydrate-selective porin OprB  31.06 
 
 		 492 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.269576 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3354  carbohydrate porin  29.01 
 
 		 504 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1247  Carbohydrate-selective porin OprB  32.85 
 
 		 512 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2652  carbohydrate porin  29.01 
 
 		 504 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.486905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0309  carbohydrate porin  29.01 
 
 		 504 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0296  carbohydrate porin  29.01 
 
 		 504 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3023  carbohydrate porin  29.01 
 
 		 504 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0489  carbohydrate porin  29.01 
 
 		 504 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2070  carbohydrate porin  29.01 
 
 		 504 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  24.6 
 
 		 481 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0267  carbohydrate porin  29.01 
 
 		 514 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4863  carbohydrate-selective porin OprB  28.79 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0852  carbohydrate-selective porin OprB  29.55 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2894  Carbohydrate-selective porin OprB  25.6 
 
 		 509 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1380  Carbohydrate-selective porin OprB  25 
 
 		 522 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.768391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3503  carbohydrate-selective porin OprB  28.79 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488626  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5422  carbohydrate-selective porin OprB  28.79 
 
 		 493 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585602  normal  0.389505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  27.46 
 
 		 674 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3558  carbohydrate-selective porin OprB  27.87 
 
 		 534 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1762  Carbohydrate-selective porin OprB  27.44 
 
 		 446 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  25.99 
 
 		 452 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  25.99 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  25.99 
 
 		 452 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  25.99 
 
 		 454 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1331  carbohydrate-selective porin OprB  26.28 
 
 		 510 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901069  hitchhiker  0.00588319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1190  Carbohydrate-selective porin OprB  25.61 
 
 		 501 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  25.48 
 
 		 422 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2771  carbohydrate-selective porin OprB  26.87 
 
 		 534 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1384  carbohydrate-selective porin OprB  24.86 
 
 		 490 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  25.48 
 
 		 422 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1659  Carbohydrate-selective porin OprB  24.86 
 
 		 490 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  25.48 
 
 		 396 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4004  carbohydrate-selective porin OprB  26.62 
 
 		 483 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2998  Carbohydrate-selective porin OprB  26.87 
 
 		 534 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  25.32 
 
 		 422 aa  42  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>