46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3784 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 243 aa  480  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  43.78 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  44.8 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  43.15 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  42.37 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  40.64 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  38.84 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  41.38 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  40.25 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  42.06 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  43.69 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  38.63 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  43.58 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  43.35 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  42.79 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  41.28 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  38.97 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  36.32 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  37.19 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  35.85 
 
 		 550 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  27.27 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  24.11 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  24.51 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  25.86 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  26.32 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  21.52 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  29.81 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  29.2 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  29.38 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  27.94 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  30.54 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  28.25 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  26.83 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  25.21 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  27.07 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  28.48 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  28.48 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  28.48 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  36.14 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  33.64 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  27.32 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  24.64 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  23.02 
 
 		 240 aa  42  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  27.35 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>