More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3320 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  100 
 
 		 376 aa  743    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  72.25 
 
 		 379 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  73.6 
 
 		 368 aa  511  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  70.08 
 
 		 362 aa  497  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  73.16 
 
 		 359 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  68.99 
 
 		 363 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  71.25 
 
 		 330 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  71.25 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  71.25 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  66.48 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  62.78 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  63.69 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.84 
 
 		 370 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  63.23 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  62.57 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  61.9 
 
 		 359 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.05 
 
 		 368 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.27 
 
 		 389 aa  398  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  61.27 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.77 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  55.65 
 
 		 382 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.88 
 
 		 328 aa  364  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.38 
 
 		 618 aa  364  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  60.06 
 
 		 361 aa  360  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  59.13 
 
 		 373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.3 
 
 		 433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  54.76 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.53 
 
 		 379 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  56.82 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  57.22 
 
 		 378 aa  342  8e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.89 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.09 
 
 		 285 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  54.67 
 
 		 383 aa  332  8e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  47.91 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  55.56 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.41 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  39.82 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  38.73 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.76 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  39.39 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  31.65 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  32.28 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  31.65 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  31.38 
 
 		 411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  29.61 
 
 		 404 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  31.12 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  31.12 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  31.12 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  31.12 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  30.85 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  30.67 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  30.85 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  30.85 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  33.77 
 
 		 399 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  31.38 
 
 		 407 aa  152  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  30.85 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  30.59 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  30.59 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  30.67 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  35.46 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0957  aspartate aminotransferase  28.83 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000423208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  32.38 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  31.03 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  33.25 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  30.59 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  29.33 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  29.66 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  30.13 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  30.05 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  28.83 
 
 		 403 aa  149  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.04 
 
 		 405 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  30.05 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  31.75 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  34.44 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  32.89 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  27.42 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  30.32 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  30.05 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  33.06 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  32.39 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  32.4 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  33.76 
 
 		 398 aa  146  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  34.16 
 
 		 398 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0165  aspartate aminotransferase  29.09 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  30.32 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  29.06 
 
 		 403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  32.12 
 
 		 397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  31.52 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  30.32 
 
 		 409 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  34.79 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  33.06 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  30.59 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0186  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  29.77 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  30.05 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  31.99 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  29.77 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  30.13 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>