More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3098 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 228 aa  453  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  53.39 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  53.64 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  53.64 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  53.64 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  49.09 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.55 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  53.1 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  47.45 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.72 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  39.91 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  41.21 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.45 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.67 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.84 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  38.89 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.15 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  38.89 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  39.79 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  38.89 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  38.43 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  41.04 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  39.79 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  39.11 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.85 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.11 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.85 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.82 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.75 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  37.37 
 
 		 225 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  37.82 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  37.82 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  37.82 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  37.89 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  37.31 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  37.82 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.82 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.33 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.08 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  36.63 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  36.63 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.56 
 
 		 223 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.46 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  35.23 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  38.81 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  35.29 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.53 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  36.5 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.9 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.41 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  33.8 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.15 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  35.94 
 
 		 221 aa  98.2  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.82 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.31 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  32.32 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.22 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  27.41 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.09 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  31.61 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.57 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.1 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.68 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  32.21 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  29.7 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  26.03 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.27 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  27.5 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.31 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.51 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  29.81 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  35.26 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  22.81 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  24.07 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.74 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.08 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  29.3 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  26.46 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  35.45 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  27.14 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  31.82 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  29.52 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  29.52 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>