219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2648 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2648  permease  100 
 
 		 288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  72.57 
 
 		 288 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  54.55 
 
 		 298 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  55.59 
 
 		 298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  54.55 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  54.55 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  54.55 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  54.55 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  54.55 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  54.55 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  54.2 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  54.55 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  54.9 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  47.97 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  48.34 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  45.77 
 
 		 371 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  44.37 
 
 		 324 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  44.37 
 
 		 324 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  44.21 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  44.21 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  44.8 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  44.01 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  36.43 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  41.18 
 
 		 346 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  36.43 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  36.68 
 
 		 524 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  38.23 
 
 		 524 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  34.26 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  33.33 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  29.43 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  29.43 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  30.9 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  34.18 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  29.97 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  32.63 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  29.72 
 
 		 350 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  33.1 
 
 		 370 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  30.41 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  38.15 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  38.17 
 
 		 334 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  36.43 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  34.47 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  35.21 
 
 		 350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  37.15 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  38.02 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  35.79 
 
 		 368 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  41.61 
 
 		 362 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  31.66 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  27.78 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  33.07 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  25.42 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  31.8 
 
 		 318 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  42.86 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  25.08 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  30.29 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  30.05 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  25.94 
 
 		 402 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  22.43 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  30.65 
 
 		 354 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  28.07 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  26.89 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  22.75 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  29.03 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  23.34 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  27.51 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  23.17 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.66 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  25.09 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  27.04 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  27.7 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  28.8 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  27.08 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  26.11 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  29.89 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  31.25 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  27.37 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  26.77 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  24.87 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  23.79 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  27.83 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  30.98 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  28.72 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  26.4 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  24.73 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  29.35 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  25.53 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  28.34 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  21.21 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  34.96 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  24.72 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  26.79 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  24.59 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  21.51 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  26.52 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  28.33 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  26.76 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  25 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  29.17 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  31.79 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  23.96 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>