More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3133 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 796 aa  1621    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  66.75 
 
 		 818 aa  1035    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  50.25 
 
 		 797 aa  751    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  81.24 
 
 		 841 aa  1318    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  45.11 
 
 		 804 aa  661    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  74.75 
 
 		 829 aa  1192    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  74.81 
 
 		 827 aa  1200    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  77.65 
 
 		 818 aa  1257    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  66.92 
 
 		 773 aa  1063    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  42.77 
 
 		 795 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  42.62 
 
 		 802 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  42.96 
 
 		 778 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  40.78 
 
 		 852 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  41.34 
 
 		 852 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  41.07 
 
 		 852 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  40.97 
 
 		 852 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  39.22 
 
 		 807 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  38.96 
 
 		 807 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  40.73 
 
 		 862 aa  559  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  38.77 
 
 		 831 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  39.45 
 
 		 831 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  41.83 
 
 		 793 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  40.56 
 
 		 777 aa  551  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  40.58 
 
 		 791 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  40.15 
 
 		 843 aa  552  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  38.77 
 
 		 830 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  38.11 
 
 		 819 aa  544  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  40.29 
 
 		 857 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  38.99 
 
 		 804 aa  545  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  39.5 
 
 		 819 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  38.96 
 
 		 830 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  38.94 
 
 		 833 aa  536  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  39.2 
 
 		 819 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.6 
 
 		 817 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  38.16 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  39.2 
 
 		 819 aa  532  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  36.67 
 
 		 814 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  37.71 
 
 		 817 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  37.95 
 
 		 807 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  39.25 
 
 		 830 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  39.04 
 
 		 832 aa  532  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  38.63 
 
 		 810 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 796 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  40.47 
 
 		 800 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  39.45 
 
 		 779 aa  525  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  36.3 
 
 		 814 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  39.45 
 
 		 794 aa  525  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  38.99 
 
 		 823 aa  523  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  38.12 
 
 		 814 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  39.48 
 
 		 908 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 803 aa  525  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  36.95 
 
 		 823 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  38.62 
 
 		 799 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  38.82 
 
 		 799 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  37.25 
 
 		 823 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  37.94 
 
 		 808 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  36.61 
 
 		 817 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  38.23 
 
 		 824 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  37.35 
 
 		 817 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 		 817 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  37.83 
 
 		 830 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  37.11 
 
 		 804 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  37.69 
 
 		 805 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  39.13 
 
 		 792 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  40.38 
 
 		 797 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  37.86 
 
 		 793 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  37.94 
 
 		 818 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  37.9 
 
 		 809 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  38.96 
 
 		 838 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  37.55 
 
 		 805 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  37.5 
 
 		 804 aa  512  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  37.03 
 
 		 793 aa  510  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  37.66 
 
 		 803 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  39.24 
 
 		 840 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  37.58 
 
 		 797 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  38.19 
 
 		 817 aa  509  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  38.27 
 
 		 797 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  38.17 
 
 		 818 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  37.76 
 
 		 797 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  38.27 
 
 		 797 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  37.58 
 
 		 805 aa  505  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  38.14 
 
 		 819 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  38.13 
 
 		 797 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  40.24 
 
 		 791 aa  505  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  37.28 
 
 		 833 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  36.22 
 
 		 815 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  37.07 
 
 		 850 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  37.76 
 
 		 795 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  38.08 
 
 		 797 aa  505  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 791 aa  506  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  37.28 
 
 		 805 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  37.07 
 
 		 850 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  37.26 
 
 		 851 aa  502  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  37.82 
 
 		 766 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  36.95 
 
 		 850 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  37.4 
 
 		 803 aa  499  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  36.32 
 
 		 846 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  36.83 
 
 		 850 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  38.43 
 
 		 799 aa  502  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  37.26 
 
 		 851 aa  502  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>