More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1509 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  583  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  45.17 
 
 
408 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  44.71 
 
 
408 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  44.71 
 
 
408 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  44.71 
 
 
408 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  36.84 
 
 
281 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  40.32 
 
 
282 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  29.93 
 
 
315 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  24.1 
 
 
290 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
306 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  31.69 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  32.79 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  29.32 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  43.52 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  30.31 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  41.82 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  27.94 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  43.52 
 
 
361 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  29.96 
 
 
345 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.06 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4175  hypothetical protein  30.74 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516461  normal  0.259895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  28.04 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  41.9 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  27.12 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  33.04 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.85 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.91 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  37.27 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  24.66 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.08 
 
 
562 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  35.48 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  25.4 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3872  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  20.43 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.493691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
474 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  25.4 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  26.64 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.4 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>