More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1139 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  100 
 
 		 306 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  86.42 
 
 		 270 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  67.83 
 
 		 240 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  69.68 
 
 		 252 aa  295  8e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  67.12 
 
 		 252 aa  292  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  71.62 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  67.89 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  66.06 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  67.95 
 
 		 268 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  60.35 
 
 		 234 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  59.83 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  64.45 
 
 		 276 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  60.3 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  63.64 
 
 		 240 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  64.18 
 
 		 276 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  58.92 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  66.53 
 
 		 250 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  58.11 
 
 		 234 aa  248  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  60.83 
 
 		 249 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  62.55 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  60.26 
 
 		 249 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  63.29 
 
 		 240 aa  245  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  69.42 
 
 		 270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  56.7 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  67.94 
 
 		 243 aa  241  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  57.58 
 
 		 239 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  63.64 
 
 		 224 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  60.4 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  57.73 
 
 		 242 aa  228  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  59.02 
 
 		 234 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  59.02 
 
 		 234 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  59.02 
 
 		 234 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  57.28 
 
 		 240 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  56.93 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  54.42 
 
 		 220 aa  206  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  46.32 
 
 		 242 aa  192  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  47.41 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  53.49 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  46.43 
 
 		 230 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  50.7 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  50.23 
 
 		 235 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  47.44 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  43.26 
 
 		 236 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.89 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  43.46 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  48.77 
 
 		 233 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  41.96 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  42.04 
 
 		 232 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  41.15 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  44.73 
 
 		 242 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  41.2 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  41.2 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  44.89 
 
 		 262 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  44.98 
 
 		 241 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  44.5 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  46.51 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  42.73 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  43.26 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  37.55 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  43.12 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  44.73 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  43.22 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  44.39 
 
 		 246 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  43.98 
 
 		 235 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  44.5 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  42.44 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  49.5 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  45.41 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  40.74 
 
 		 231 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  39.21 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  39.65 
 
 		 229 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  46.38 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  46.38 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  48.22 
 
 		 385 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  41.15 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  39.21 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  42.38 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  39.75 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  40.55 
 
 		 229 aa  149  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  45.41 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  43.66 
 
 		 230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  46.19 
 
 		 233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  45.07 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  42.59 
 
 		 231 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  43.12 
 
 		 245 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  40.45 
 
 		 225 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  40.45 
 
 		 225 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  44.49 
 
 		 228 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  42 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  42 
 
 		 245 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  42 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  44.5 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  36.75 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  42 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  42 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  42 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  42 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  42 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.53 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37.39 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>