More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1658 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  100 
 
 
265 aa  535  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  49.8 
 
 
271 aa  232  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  49.39 
 
 
271 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  46.27 
 
 
271 aa  223  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  39.69 
 
 
278 aa  201  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.6 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  40.83 
 
 
430 aa  176  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  37.4 
 
 
412 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  37.02 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  37.14 
 
 
324 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  43.01 
 
 
404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  52.41 
 
 
375 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  57.63 
 
 
375 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  56.45 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  55.74 
 
 
305 aa  138  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  55.17 
 
 
411 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  53.54 
 
 
376 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  53.97 
 
 
379 aa  135  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  34.96 
 
 
582 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  35.32 
 
 
417 aa  133  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  48.23 
 
 
374 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  36.82 
 
 
419 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  34.96 
 
 
452 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  33.46 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  53.39 
 
 
377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  50.41 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  53.97 
 
 
374 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  49.57 
 
 
460 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  45 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  54.78 
 
 
735 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  45.88 
 
 
824 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  48.63 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  34.82 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  52.07 
 
 
475 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  51.2 
 
 
377 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  54.17 
 
 
314 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  44.38 
 
 
282 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  32.91 
 
 
307 aa  125  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  54.46 
 
 
529 aa  125  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  51.69 
 
 
375 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  49.25 
 
 
274 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  54.39 
 
 
687 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  52.68 
 
 
523 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  37.36 
 
 
230 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  49.6 
 
 
538 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  41.25 
 
 
303 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  32.27 
 
 
294 aa  123  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  50 
 
 
373 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  31.4 
 
 
402 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  47.83 
 
 
248 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  50 
 
 
399 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  43.97 
 
 
372 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  43.59 
 
 
441 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  47.66 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  51.69 
 
 
379 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  52.14 
 
 
469 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  49.14 
 
 
399 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  42.86 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  52.14 
 
 
469 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  36.32 
 
 
358 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  51.3 
 
 
453 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  51.3 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  48.78 
 
 
223 aa  119  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  32.03 
 
 
468 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  50 
 
 
751 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  51.72 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  49.57 
 
 
400 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
754 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  39.88 
 
 
225 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  35.51 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  52.42 
 
 
402 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  47.58 
 
 
431 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  33.33 
 
 
445 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  51.3 
 
 
404 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  46.36 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  50 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  50 
 
 
238 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  48.48 
 
 
590 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  54.55 
 
 
194 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  57.43 
 
 
414 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  45.7 
 
 
198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  49.57 
 
 
443 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  37.04 
 
 
309 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  32.65 
 
 
297 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  51.89 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  43.9 
 
 
229 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  33.47 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  42.07 
 
 
446 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  39.89 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  50.86 
 
 
442 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  50 
 
 
333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  49.17 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  47.83 
 
 
454 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  49.57 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  37.16 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  49.57 
 
 
455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  47.46 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  46.92 
 
 
482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.5 
 
 
304 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  35.17 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>