More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1176 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 647 aa  1318    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  53.22 
 
 		 815 aa  571  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  51.36 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  51.36 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  36.96 
 
 		 499 aa  257  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  36.6 
 
 		 454 aa  246  8e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  36.26 
 
 		 654 aa  240  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  36.14 
 
 		 455 aa  238  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  32.64 
 
 		 595 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  33.2 
 
 		 515 aa  234  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  32.64 
 
 		 593 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  33.71 
 
 		 509 aa  223  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  32.07 
 
 		 541 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  33.4 
 
 		 583 aa  223  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  30.69 
 
 		 541 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  30.16 
 
 		 545 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  31.37 
 
 		 575 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  33.06 
 
 		 493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  29.71 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  30.27 
 
 		 1138 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  31.68 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  30.47 
 
 		 1137 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  30.47 
 
 		 1137 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  30.47 
 
 		 1137 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  30.5 
 
 		 1114 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  30.21 
 
 		 1137 aa  204  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  29.53 
 
 		 544 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  30.6 
 
 		 1137 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.92 
 
 		 1136 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  30.36 
 
 		 1123 aa  201  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  52.58 
 
 		 258 aa  200  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  31.14 
 
 		 548 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  29.59 
 
 		 1115 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  29.9 
 
 		 1154 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  29.9 
 
 		 1154 aa  197  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  29.98 
 
 		 1131 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  29.98 
 
 		 1131 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  29.98 
 
 		 1131 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  29.98 
 
 		 1131 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  29.98 
 
 		 1131 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  29.9 
 
 		 1152 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  29.98 
 
 		 1131 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  29.62 
 
 		 1116 aa  193  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  30.79 
 
 		 572 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  29.57 
 
 		 537 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  29.42 
 
 		 1116 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  28.37 
 
 		 1108 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  29.17 
 
 		 964 aa  191  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  28.25 
 
 		 562 aa  191  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  29.8 
 
 		 606 aa  190  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  29.53 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  30.99 
 
 		 1093 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  30.36 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  30.36 
 
 		 572 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  30.16 
 
 		 1102 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  28.49 
 
 		 1109 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  29.31 
 
 		 1093 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  28.77 
 
 		 1121 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  28.87 
 
 		 553 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  28.81 
 
 		 1108 aa  187  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  29.26 
 
 		 544 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  29.62 
 
 		 1102 aa  187  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  29.62 
 
 		 1102 aa  187  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  29.05 
 
 		 1098 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  31.23 
 
 		 577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.11 
 
 		 1092 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  29.33 
 
 		 553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  29.7 
 
 		 1098 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  30.08 
 
 		 1100 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  27.68 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  28.4 
 
 		 591 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  32.21 
 
 		 441 aa  185  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  29.18 
 
 		 1111 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  29.84 
 
 		 1100 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  29.31 
 
 		 1098 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  28.81 
 
 		 1061 aa  184  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  28.99 
 
 		 1088 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  28.99 
 
 		 1088 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  29.71 
 
 		 1112 aa  184  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  29.61 
 
 		 554 aa  184  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  29.56 
 
 		 1142 aa  184  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  29.68 
 
 		 562 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  29.62 
 
 		 1119 aa  183  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  28.35 
 
 		 1110 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  27.86 
 
 		 1121 aa  183  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  28.71 
 
 		 1099 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  28.71 
 
 		 1113 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  31.78 
 
 		 441 aa  182  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  28.76 
 
 		 1108 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  30.33 
 
 		 1098 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 549 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  30.1 
 
 		 524 aa  182  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  28.44 
 
 		 572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  29.09 
 
 		 543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  29.54 
 
 		 1088 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  29.33 
 
 		 1130 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  27.64 
 
 		 1108 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  29.05 
 
 		 1104 aa  181  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>