More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0727 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  48.86 
 
 		 740 aa  707    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  100 
 
 		 760 aa  1532    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  43.76 
 
 		 740 aa  617  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  29.61 
 
 		 746 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  31.53 
 
 		 720 aa  251  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  31.27 
 
 		 736 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  34.5 
 
 		 727 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.26 
 
 		 751 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  35.68 
 
 		 739 aa  226  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  34.25 
 
 		 728 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  31.55 
 
 		 738 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  28.95 
 
 		 667 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  34.63 
 
 		 733 aa  224  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  35.95 
 
 		 738 aa  224  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  35.95 
 
 		 738 aa  224  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  34.5 
 
 		 734 aa  223  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  29.55 
 
 		 767 aa  223  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33.26 
 
 		 728 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  29.61 
 
 		 751 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  30.59 
 
 		 754 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  34.88 
 
 		 735 aa  220  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.33 
 
 		 728 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  27.86 
 
 		 737 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  35.63 
 
 		 741 aa  218  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  34.26 
 
 		 745 aa  216  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  25.83 
 
 		 804 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  34.5 
 
 		 738 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  34.5 
 
 		 737 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  34.32 
 
 		 738 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  30.55 
 
 		 748 aa  214  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  30.09 
 
 		 738 aa  213  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  34.23 
 
 		 738 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  31.79 
 
 		 753 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  31.12 
 
 		 777 aa  210  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  36.72 
 
 		 728 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  33.5 
 
 		 737 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.66 
 
 		 728 aa  207  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  37.71 
 
 		 735 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  31.12 
 
 		 750 aa  205  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  25 
 
 		 933 aa  204  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  25 
 
 		 945 aa  204  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  29.07 
 
 		 790 aa  204  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  25 
 
 		 728 aa  204  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  25.63 
 
 		 930 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  25.63 
 
 		 920 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  25.43 
 
 		 803 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  25.43 
 
 		 803 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  26.21 
 
 		 852 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  25.43 
 
 		 803 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  26.95 
 
 		 796 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  26.27 
 
 		 798 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  24.83 
 
 		 714 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  26.52 
 
 		 813 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  26.27 
 
 		 707 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  28.06 
 
 		 771 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  27.41 
 
 		 764 aa  192  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  34.38 
 
 		 745 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  27.51 
 
 		 776 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  25.93 
 
 		 733 aa  172  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  28.4 
 
 		 775 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  32.29 
 
 		 333 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  31.94 
 
 		 320 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  35.09 
 
 		 256 aa  163  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  32.02 
 
 		 950 aa  162  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  31.71 
 
 		 320 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  33 
 
 		 275 aa  160  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  32.88 
 
 		 923 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  31.53 
 
 		 900 aa  159  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  33.33 
 
 		 311 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  33.56 
 
 		 909 aa  157  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.57 
 
 		 320 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  31.44 
 
 		 275 aa  154  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  34.67 
 
 		 316 aa  153  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  31.58 
 
 		 875 aa  152  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  32.41 
 
 		 275 aa  151  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.8 
 
 		 311 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.62 
 
 		 263 aa  151  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  31.27 
 
 		 293 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.33 
 
 		 263 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  30.03 
 
 		 262 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  34.02 
 
 		 330 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.68 
 
 		 323 aa  146  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.26 
 
 		 263 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.86 
 
 		 323 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.97 
 
 		 263 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  31.43 
 
 		 272 aa  144  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  32.88 
 
 		 273 aa  144  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  31.68 
 
 		 346 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.33 
 
 		 315 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  28.34 
 
 		 324 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  32.9 
 
 		 349 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  31.9 
 
 		 263 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.9 
 
 		 263 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  31.9 
 
 		 263 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  31.9 
 
 		 263 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  31.23 
 
 		 346 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.9 
 
 		 263 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  31.83 
 
 		 253 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  29.45 
 
 		 300 aa  139  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  32.16 
 
 		 298 aa  139  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>