More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0768 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 799 aa  1654    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  54.77 
 
 		 592 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  52.01 
 
 		 587 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  51.31 
 
 		 589 aa  582  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  39.9 
 
 		 675 aa  409  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  40.03 
 
 		 580 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  38.72 
 
 		 569 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.92 
 
 		 586 aa  389  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  38.2 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  38.02 
 
 		 611 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  39.92 
 
 		 676 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  39.87 
 
 		 673 aa  355  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  39.92 
 
 		 676 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  39.67 
 
 		 661 aa  353  8.999999999999999e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  40.45 
 
 		 670 aa  353  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.21 
 
 		 663 aa  350  5e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  40.04 
 
 		 673 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  36.65 
 
 		 607 aa  339  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.83 
 
 		 680 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  38.14 
 
 		 708 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  39.09 
 
 		 661 aa  329  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  36.18 
 
 		 686 aa  328  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.99 
 
 		 676 aa  327  6e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  36.92 
 
 		 552 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 		 661 aa  326  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  36.8 
 
 		 806 aa  325  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  36.43 
 
 		 655 aa  323  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  37.42 
 
 		 709 aa  323  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  34.56 
 
 		 608 aa  323  9.000000000000001e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  38.75 
 
 		 658 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  38 
 
 		 728 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.12 
 
 		 644 aa  318  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  37.38 
 
 		 683 aa  317  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  38.48 
 
 		 777 aa  317  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  37.94 
 
 		 659 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  38.3 
 
 		 661 aa  313  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  36.62 
 
 		 725 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  31 
 
 		 636 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  37.8 
 
 		 677 aa  299  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  31.85 
 
 		 647 aa  289  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  35.27 
 
 		 793 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  35.02 
 
 		 794 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  38.73 
 
 		 710 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  36.99 
 
 		 790 aa  279  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  33.01 
 
 		 783 aa  278  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  36.01 
 
 		 793 aa  278  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  34.67 
 
 		 829 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  34.88 
 
 		 725 aa  276  8e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  33.47 
 
 		 659 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  35.71 
 
 		 763 aa  273  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  34.3 
 
 		 787 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  34.69 
 
 		 778 aa  268  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  35.85 
 
 		 675 aa  266  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  34.69 
 
 		 675 aa  260  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  31.79 
 
 		 691 aa  233  9e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  38.41 
 
 		 316 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  53.67 
 
 		 395 aa  197  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  50.27 
 
 		 463 aa  179  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  28.47 
 
 		 697 aa  147  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.47 
 
 		 587 aa  143  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.17 
 
 		 822 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  28.73 
 
 		 574 aa  138  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  29.01 
 
 		 574 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  27.47 
 
 		 523 aa  136  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  27.47 
 
 		 508 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.28 
 
 		 574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  31.28 
 
 		 585 aa  128  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  26.67 
 
 		 495 aa  127  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.12 
 
 		 633 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.88 
 
 		 508 aa  124  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  25.85 
 
 		 499 aa  124  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  26.25 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  25.47 
 
 		 499 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  25.67 
 
 		 522 aa  122  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  27.4 
 
 		 496 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  26.61 
 
 		 816 aa  121  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  26.86 
 
 		 496 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.16 
 
 		 498 aa  120  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  37.62 
 
 		 371 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  25.22 
 
 		 504 aa  119  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  27.18 
 
 		 824 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  27.25 
 
 		 493 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  27.4 
 
 		 527 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  27.92 
 
 		 814 aa  115  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  27.34 
 
 		 499 aa  115  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  24.94 
 
 		 503 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  24.34 
 
 		 527 aa  114  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  27.59 
 
 		 505 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  24.65 
 
 		 508 aa  114  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  25.69 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  38.12 
 
 		 356 aa  112  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  24.04 
 
 		 523 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  27.03 
 
 		 863 aa  111  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  27.21 
 
 		 510 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  25.88 
 
 		 505 aa  110  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  24.67 
 
 		 492 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  26.23 
 
 		 815 aa  110  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.96 
 
 		 462 aa  110  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  24.95 
 
 		 526 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 511 aa  109  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>