More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2884 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  724    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  48.36 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  50.15 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  40.55 
 
 		 359 aa  248  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  42.81 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  22.81 
 
 		 708 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.03 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  30.29 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3199  hypothetical protein  26.67 
 
 		 700 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000232699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  32.12 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  27.3 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  27.8 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  27.67 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.27 
 
 		 697 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.4 
 
 		 746 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  33.11 
 
 		 363 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  32.7 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  30.8 
 
 		 732 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  30.12 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.1 
 
 		 699 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  31.14 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  27.52 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  31.87 
 
 		 691 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  31.14 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  31.14 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  30.8 
 
 		 731 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  35.29 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  30.77 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  30.95 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  30.36 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  30.88 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  30.88 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  30.36 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  30.36 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  29.12 
 
 		 725 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  30.36 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  30.46 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  30.46 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  30.46 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  27.1 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  28.98 
 
 		 700 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  30.46 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  30.46 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.73 
 
 		 699 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  30.99 
 
 		 704 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.85 
 
 		 740 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  34.07 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  34.07 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 		 725 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  29.48 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 		 725 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  30.97 
 
 		 682 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  25.79 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  28.74 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  30.46 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  27.54 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.74 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  29.65 
 
 		 730 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  28.41 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  27.36 
 
 		 726 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  28.9 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  28.41 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  28.41 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  25.55 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  30.77 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  25.85 
 
 		 151 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  25.83 
 
 		 733 aa  56.6  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  29.76 
 
 		 687 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  28.64 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  29.17 
 
 		 664 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  29.45 
 
 		 690 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  29.11 
 
 		 698 aa  56.2  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  29.89 
 
 		 728 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  29.45 
 
 		 711 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  29.45 
 
 		 690 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  28.97 
 
 		 681 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  29.71 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0706  hypothetical protein  28.25 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  27.31 
 
 		 702 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0145  hypothetical protein  27.76 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.45 
 
 		 690 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  29.71 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  28.16 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  26.89 
 
 		 695 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0235  hypothetical protein  26.88 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.32 
 
 		 670 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  27.43 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  29.89 
 
 		 676 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  29.21 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  30.46 
 
 		 727 aa  53.9  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  28 
 
 		 625 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  27.18 
 
 		 697 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  30.72 
 
 		 659 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.89 
 
 		 688 aa  53.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  27.52 
 
 		 718 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  30 
 
 		 662 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  27.92 
 
 		 713 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>