36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0595 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 633 aa  1276    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  100 
 
 		 633 aa  1276    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  37.4 
 
 		 720 aa  357  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  37.48 
 
 		 699 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  38.96 
 
 		 688 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  38.96 
 
 		 688 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  38.96 
 
 		 688 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  38.14 
 
 		 665 aa  346  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  40.19 
 
 		 660 aa  342  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.8 
 
 		 671 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  36.07 
 
 		 663 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  37.41 
 
 		 680 aa  300  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  33.04 
 
 		 600 aa  292  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  45.98 
 
 		 679 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  43.24 
 
 		 773 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  28.45 
 
 		 708 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  28.33 
 
 		 683 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  28.33 
 
 		 683 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  28.33 
 
 		 683 aa  171  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  29.06 
 
 		 683 aa  171  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.06 
 
 		 683 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  28.14 
 
 		 683 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  27.58 
 
 		 683 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  28.66 
 
 		 683 aa  167  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  28.74 
 
 		 360 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  25.83 
 
 		 702 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.36 
 
 		 697 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0235  hypothetical protein  25.53 
 
 		 376 aa  50.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.93 
 
 		 670 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  28.91 
 
 		 638 aa  48.5  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  27.94 
 
 		 638 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.73 
 
 		 691 aa  47  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  27.85 
 
 		 698 aa  46.2  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  27.75 
 
 		 687 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25.32 
 
 		 395 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  27.17 
 
 		 388 aa  44.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>